Phylogenetic Analysis of Two Rabies Viruses, Takamen and Komatsugawa Strains Isolated in Japan in the 1940's
Notice bibliographique
Résumé
The entire coding region of the nucleoprotein (N) gene of Takamen and Komatsugawa strains of rabies virus isolated in Japan in 1940's were determined. Phylogenetic analysis was performed on 140 lyssaviruses (128 viruses of genotype 1 and 12 lyssaviruses of other genotypes) isolated in various parts of the world, including the two Japanese rabies strains, based on the sequences of 1,350 nucleotides of the N gene. The rabies viruses were divided into 12 distinct clusters at least, reflecting geographical areas and hosts as reservoirs. The Takamen, Nishigahara, and RC-HL strains derived from the Nishigahara strain were grouped into the same cluster as the Chinese strain (3aG) in the worldwide distribution group. The Komatsugawa strain was grouped into the same cluster as the viruses from a raccoon dog from Khabarovsk, and from a steppe fox in area of Lake Baikal in Russia in a group consisting of Canada, Greenland, and the Arctic. These data along with the historical evidence suggest that Japanese rabies viruses, the Takamen and Komatsugawa strains, belong to two different clusters and moved into Japan from China and Russia, respectively.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».