MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1536624913 · doi:10.1096/fasebj.21.6.lb102

The use of DNPH‐derivatized protein carbonyls as a marker of oxidative stress in mouse heart and liver

2007· article· en· W1536624913 sur OpenAlexaff
Heathcliff D’Sa, Bart P. Hettinga, Adeel Safdar, Mark A. Tarnopolsky, Mazen J. Hamadeh, Sandeep Raha

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCoenzyme Q10 studies and effects
Établissements canadiensYork UniversityMcMaster UniversityMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOxidative stressProtein CarbonylationChemistryReactive oxygen speciesOxidative phosphorylationSuperoxide dismutaseBiomarkerBiochemistryMolecular biologyOxidative damageBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reactive oxygen species (ROS) have been shown to modify proteins, lipids and DNA. These modified biomolecules serve as markers for the quantification of oxidative stress in various physiological and diseased conditions. Identification and quantification of a marker of protein oxidation (i.e., protein carbonyls) in tissues continue to be time consuming and/or costly. To identify and quantify this biomarker, we utilized a mouse model of ALS (G93A) having a mutant human Cu/Zn‐superoxide dismutase gene resulting in elevated levels of ROS. Using spectroscopic methods, we previously reported that the G93A mouse has 53% higher protein carbonyls in the skeletal muscle as compared with wild‐type littermates. However, these methods require large amounts of sample. In this study, we present a comparison of immunochemical methods, using DNPH‐derivatized carbonyls (Oxyblot, Chemicon International vs. ELISA), to assess oxidative stress. A protein with an apparent molecular weight of 28 kDa proved to associate well with established patterns of oxidative stress in these animals. Higher carbonyl content (80%) was found in the liver of G93A versus wild‐type mice (5165 ± 741 AU vs. 2869 ± 762 AU, mean ± SEM, P = 0.044). Most importantly, this analysis required, at most, 3 μg of sample and is a more sensitive and biologically relevant measure of oxidative stress as compared with ELISA‐based methods. In summary, we have identified and quantified a 28 kDa protein that can serve as a measure of protein oxidative damage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,185

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB JournalMême sujetCoenzyme Q10 studies and effectsTravaux en français237 207