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Enregistrement W1536849030 · doi:10.1158/1538-7445.sabcs14-p1-07-29

Abstract P1-07-29: The role of cytoplasmic polyadenylation element binding protein-2 in breast cancer

2015· article· en· W1536849030 sur OpenAlexaff
Asma Hasan, Mousumi Majumder, Peeyush K. Lala

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchBreast cancerGene silencingCancerMetastasisBiologymicroRNAClonogenic assayCancer cellTransfectionCell cultureGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: We had shown that over-expression of the inflammation-associated enzyme cyclo-oxygenase (COX)-2 promotes breast cancer progression and metastasis and sustains stem-like cells (SLC), believed to evade traditional therapy and promote tumor reoccurrence. Stable transfection of the COX-2 gene into COX-2–, HER-2–, non-metastatic human MCF-7 breast cancer cell line (named MCF-7-COX-2) led to a highly aggressive phenotype in vitro, where we observed epithelial-mesenchymal transition, increased migration, invasion, clonogenic tumorsphere forming ability (surrogate of SLC) and expression of SLC marker ALDH. Furthermore, we observed an increase in the tumorigenic and metastatic capacity of the cells in immuno-compromised mice in vivo. Combined gene expression and microRNA (miRNA) micro-array analysis of MCF-7 and MCF-7-COX-2 cells revealed COX-2 induced up-regulation of two miRNAs, miR-526b and miR-655, and down-regulation of their common gene target, cytoplasmic polyadenylation element binding protein (CPEB)-2. While both miRNAs were found to be oncogenic in functional assays, the function of CPEB-2 in breast cancer remains untested. Hypothesis: miR-526b and miR-655 down-regulate CPEB-2 to promote breast cancer cell aggressiveness and the SLC phenotype. Approaches & Results: (1) To test if expression levels of COX-2 and CPEB-2 are inversely related, we measured both gene and protein expression in multiple COX-2 disparate breast cancer cell lines. (2) We also tested if there is an inverse relationship between miRNA expression and the expression levels of their target gene CPEB-2. We found that high COX-2/miRNA expressing cell lines such as MDA-MB-231 and MCF-7-COX-2 had significantly lower expression of CPEB-2 than MCF-7 cells (low COX-2/low miRNA). (3) To test the functional effects of CPEB-2 gene manipulation in vitro and in vivo, we knocked down CPEB-2 in CPEB-2-high MCF-7 cell line. MCF-7-CPEB-2-KD cells were found to be more migratory and invasive than control cells in transwell assays. Ongoing studies are to test (a) whether there is a cause and effect relationship between the expression of the miRNAs and CPEB-2 expression, that is, whether knocking down or knocking in the miRNAs respectively up-regulates and down-regulates CPEB-2 expression; and (b) whether CPEB-2 expression is lower in breast cancer tissues than in adjacent non-tumor tissues, and inversely correlated with the miRNAs in breast cancer tissues. Conclusion and Significance: If CPEB-2 is proven to be tumor suppressor, these oncogenic miRNAs and putatively anti-oncogenic CPEB-2 may serve as potential biomarkers in personalizing breast cancer therapy with COX-2 inhibitors as adjuvant. (Supported by funds of the OICR to PKL. AH and MM are CaRTT/TBCRU scholars). Citation Format: Asma Hasan, Mousumi Majumder, Peeyush K Lala. The role of cytoplasmic polyadenylation element binding protein-2 in breast cancer [abstract]. In: Proceedings of the Thirty-Seventh Annual CTRC-AACR San Antonio Breast Cancer Symposium: 2014 Dec 9-13; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(9 Suppl):Abstract nr P1-07-29.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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