Notice bibliographique
Résumé
Lack of functional Fragile X mental retardation protein (FMRP) is the primary cause of the Fragile-mental retardation syndrome in humans. In most cases, the disease results from transcriptional silencing of fragile mental retardation gene 1, fmr1, which encodes FMRP. However, a single missense mutation (I304N) in the second KH domain of FMRP gives rise to a particularly severe case of Fragile X syndrome. A Drosophila homolog of FMRP has been identified, Drosophila Fragile X related protein (dFXRP). The corresponding missense mutation in dFXRP, the I307N, has pronounced effects on the in vivo activity of the protein. The effect of the point mutation on the structure and function of FMRP is unclear, and published data are contradictory. No in vitro structural or stability studies have been performed on dFXRP. Here we show that a construct that contains only the tandem KH1-KH2 domains is a stable, well-folded unit suitable for detailed structural and functional characterization. Using this KH1-KH2 construct we explicitly test a hypothesis that has been proposed to explain the effect of the Ile-->Asn mutation: that it causes complete unfolding of the protein. Here we show that the I307N point mutation does not completely unfold the KH domain. The KH1-KH2 construct bearing I307N substitution is stable in isolation and adopts a native-like fold. Thus our data favor alternative explanations for the in vivo observed loss of dFXRP activity associated with I307N mutation: (a) the point mutation might affect intra and/or inter-molecular interactions of dFXRP; or (b) it might impair dFXRP's interactions with its RNA target(s).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».