Development of Functional Markers for a Lipoxygenase Gene <i>TaLox‐B1</i> on Chromosome 4BS in Common Wheat
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Lipoxygenase (LOX) activity in grain influences the color and processing quality of wheat ( Triticum spp.)‐based products. Characterization of LOX genes and development of functional markers are of importance for marker‐assisted selection in common wheat ( Triticum aestivum L.) breeding. In the present study, the full‐length genomic DNA (gDNA) sequence of a LOX gene (designated TaLox‐B1 ) located on chromosome 4BS was characterized by in silico cloning and experimental validation. Two complementary dominant sequence tagged site (STS) markers, LOX16 and LOX18, were developed based on the single nucleotide polymorphism (SNP) of two alleles at the TaLox‐B1 locus, amplifying 489‐ and 791‐bp fragments in cultivars with higher and lower LOX activities, respectively. The two markers were mapped on chromosome 4BS using a doubled haploid (DH) population derived from Zhongyou 9507 × CA9632, a set of Chinese Spring nullisomic–tetrasomic lines, ditelosomic line 4BS, and Langdon (LDN) 4D(4B) chromosome substitution line. Quantitative trait loci (QTL) analysis indicated that TaLox‐B1 co‐segregated with the two functional markers and was closely linked to simple sequence repeat (SSR) locus Xgwm251 on chromosome 4BS with a genetic distance of 1.8 cM. LOX16 and LOX18 were validated on 198 Chinese wheat cultivars and advanced lines and showed highly significant ( p < 0.01) associations with LOX activity. These results suggested that LOX16 and LOX18, co‐segregating with TaLox‐B1 , could be used for the improvement of color attributes of noodles and other wheat‐based products in wheat breeding programs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».