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Enregistrement W1544678760 · doi:10.1111/j.1462-5822.2010.01470.x

The pathogenic E. coli type III effector EspZ interacts with host CD98 and facilitates host cell prosurvival signalling

2010· article· en· W1544678760 sur OpenAlexafffund
Stephanie R. Shames, Wanyin Deng, Julian A. Guttman, Carmen L. de Hoog, Yuling Li, Philip R. Hardwidge, Ho Pan Sham, Bruce A. Vallance, Leonard J. Foster, B. Brett Finlay

Notice bibliographique

RevueCellular Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensBC Children's HospitalCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyEffectorEnteropathogenic Escherichia coliType three secretion systemSecretionVirulencePhosphorylationMicrobiologyCell biologyImmunoprecipitationCell cultureGeneGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enterohaemorrhagic and enteropathogenic Escherichia coli (EHEC and EPEC respectively) are diarrhoeal pathogens that cause the formation of attaching and effacing (A/E) lesions on infected host cells. These pathogens encode a type III secretion system (T3SS) used to inject effector proteins directly into host cells, an essential requirement for virulence. In this study, we identified a function for the type III secreted effector EspZ. Infection with EPEC DeltaespZ caused increased cytotoxicity in HeLa and MDCK cells compared with wild-type EPEC, and expressing espZ in cells abrogated this effect. Using yeast two-hybrid, proteomics, immunofluorescence and co-immunoprecipitation, it was demonstrated that EspZ interacts with the host protein CD98, which contributes to protection against EPEC-mediated cytotoxicity. EspZ enhanced phosphorylation of focal adhesion kinase (FAK) and AKT during infection with EPEC, but CD98 only appeared to facilitate FAK phosphorylation. This study provides evidence that EspZ and CD98 promote host cell survival mechanisms involving FAK during A/E pathogen infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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