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Enregistrement W155053962 · doi:10.3760/cma.j.issn.0366-6999.20130169

Differential expression of the RNA-binding motif protein 3 in human astrocytoma

2013· article· en· W155053962 sur OpenAlexaff
Haitao Zhang, Zhiwen Zhang, Jing-hui Xue, Haibo Kong, Aijun Liu, Shouchun Li, Yuxiao Liu, XU Dong-gang

Notice bibliographique

RevueChinese Medical Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThermal Regulation in Medicine
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryAstrocytomaMessenger RNAHuman brainDownregulation and upregulationBiologyBlotPathologyReal-time polymerase chain reactionGliomaMolecular biologyGeneCancer researchMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The RNA-binding motif protein 3 (RBM3), which is transcriptionally induced by low temperature and hypoxia, has recently been found to be upregulated in human tumors. However, its expression status in human astrocytoma is not well defned. This article focuses on the differential expression of RBM3 in human astrocytomas of different grades and normal brain tissues. METHODS: RBM3 was detected in astrocytomas and normal brain tissues by quantitative real-time PCR, immunohistochemistry, and Western blotting. Analysis of variance was performed on the data from quantitative real-time PCR. The Fisher's exact test was used to analyze the immunohistochemistry results. A P-value of less than 0.05 indicates a statistically significant difference. RESULTS: On one hand, the mRNA expression levels of three X-chromosome-related RBM genes (RBMX, RBM3, and RBM10) were detected by quantitative real-time PCR. The results showed that there were no significant differences in RBMX and RBM10 mRNA expression levels in human astrocytomas of different grades and normal brain tissues. However, RBM3 mRNA expression levels were elevated in high-grade (World Health Organization (WHO) Grade III-IV) astrocytomas versus low-grade (WHO Grade I-II) astrocytomas (5.06 ± 0.66 vs. 1.60 ± 0.58; P < 0.05) or normal controls (5.06 ± 0.66 vs. 1.03 ± 0.22; P < 0.05) as determined by quantitative real-time PCR analysis. On the other hand, immunohistochemistry showed an increased RBM3 labeling index in astrocytomas of different grades and normal brain tissues (positive staining rate: astrocytoma Grade IV, 92.9%; astrocytoma Grade III, 81.8%; astrocytoma Grade I-II, 50%; normal brain tissues, 37.5%; high-grade astrocytoma versus normal brain tissues, P < 0.05; high-grade astrocytoma versus low-grade astrocytoma, P < 0.05). The higher protein levels of RBM3 were also validated in high-grade astrocytomas and low-grade astrocytomas compared with normal brain tissues by Western blotting. CONCLUSIONS: These data suggest that the overexpression of RBM3 may serve as an important molecular mechanism underlying astrocytic carcinogenesis. Moreover, RBM3 may have proliferative and/or proto-oncogenic functions in human astrocytomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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