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Enregistrement W1551601537 · doi:10.1385/0-89603-229-9:135

Preparation and Separation of Intact Chromosomes of Vertebrates by One-Dimensional Pulsed-Field Gel Electrophoresis (ODPFGE)

2003· article· en· W1551601537 sur OpenAlexaff
Jaan Noolandi, Chantal Turmel

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensXerox (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetaphasePulsed-field gel electrophoresisMolecular biologyChromosomeSpermidineBiologyElectrophoresisGel electrophoresisLysisPopulationSpermineGeneticsBiochemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This novel way of preparing chromosomes for pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) takes advantage of the fact that the whole chromosome population is synchronized in metaphase. This is a very important step toward their intact separation by PFGE; for instance, a standard preparation as used for digestion with rarecutter enzymes shows a different pattern of resolution, characterized by diffuse bands and nonspecific migration (see Chapter 7 ). Here, vertebrate chromosomal DNA was prepared by a modified chromosome isolation procedure for flow cytometry (1). This procedure involves lysis of cells (blocked in metaphase by colcemide) with digitonine in the presence of spermidine and spermine as described below. The structural integrity of metaphase-blocked chromosomes is given by the presence of spermine and spermidine, which act as chromosomal morphology stabilizers. The digestion with proteinase K is carried out as described before in order to eliminate chromosomal proteins. The pulse parameters for separating intact chicken microchromosomes by one-dimensional pulsed-field gel electrophoresis (ODPFGE) are also given.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,456

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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