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Enregistrement W1552800067 · doi:10.1128/jvi.00845-15

Sequence-Specific Modifications Enhance the Broad-Spectrum Antiviral Response Activated by RIG-I Agonists

2015· article· en· W1552800067 sur OpenAlexaff
Cindy Chiang, Vladimir Beljanski, Kevin Yin, David Olagnier, Fethia Ben Yebdri, Courtney Steel, Marie-Line Goulet, Victor R. DeFilippis, Daniel N. Streblow, Elias K. Haddad, Lydie Trautmann, Ted M. Ross, Rongtuan Lin, John Hiscott

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésBiologyRIG-IVirologyVirusInnate immune systemTLR3Influenza A virusViral replicationChikungunyaDengue virusInterferonViral pathogenesisTLR7Antiviral drugRNA virusRNAImmune systemImmunologyToll-like receptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: The cytosolic RIG-I (retinoic acid-inducible gene I) receptor plays a pivotal role in the initiation of the immune response against RNA virus infection by recognizing short 5'-triphosphate (5'ppp)-containing viral RNA and activating the host antiviral innate response. In the present study, we generated novel 5'ppp RIG-I agonists of varieous lengths, structures, and sequences and evaluated the generation of the antiviral and inflammatory responses in human epithelial A549 cells, human innate immune primary cells, and murine models of influenza and chikungunya viral pathogenesis. A 99-nucleotide, uridine-rich hairpin 5'pppRNA termed M8 stimulated an extensive and robust interferon response compared to other modified 5'pppRNA structures, RIG-I aptamers, or poly(I·C). Interestingly, manipulation of the primary RNA sequence alone was sufficient to modulate antiviral activity and inflammatory response, in a manner dependent exclusively on RIG-I and independent of MDA5 and TLR3. Both prophylactic and therapeutic administration of M8 effectively inhibited influenza virus and dengue virus replication in vitro. Furthermore, multiple strains of influenza virus that were resistant to oseltamivir, an FDA-approved therapeutic treatment for influenza, were highly sensitive to inhibition by M8. Finally, prophylactic M8 treatment in vivo prolonged survival and reduced lung viral titers of mice challenged with influenza virus, as well as reducing chikungunya virus-associated foot swelling and viral load. Altogether, these results demonstrate that 5'pppRNA can be rationally designed to achieve a maximal RIG-I-mediated protective antiviral response against human-pathogenic RNA viruses. IMPORTANCE: The development of novel therapeutics to treat human-pathogenic RNA viral infections is an important goal to reduce spread of infection and to improve human health and safety. This study investigated the design of an RNA agonist with enhanced antiviral and inflammatory properties against influenza, dengue, and chikungunya viruses. A novel, sequence-dependent, uridine-rich RIG-I agonist generated a protective antiviral response in vitro and in vivo and was effective at concentrations 100-fold lower than prototype sequences or other RNA agonists, highlighting the robust activity and potential clinical use of the 5'pppRNA against RNA virus infection. Altogether, the results identify a novel, sequence-specific RIG-I agonist as an attractive therapeutic candidate for the treatment of a broad range of RNA viruses, a pressing issue in which a need for new and more effective options persists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil0,645

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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