DNA methylation and single nucleotide variants in the brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and oxytocin receptor (OXTR) genes are associated with anxiety/depression in older women
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Environmental effects and personal experiences could be expressed in individuals through epigenetic non-structural changes such as DNA methylation. This methylation could up- regulate or down-regulate corresponding gene expressions and modify related phenotypes. DNA methylation increases with aging and could be related to the late expression of some forms of mental disease. The objective of this study was to evaluate the association between anxiety disorders and/or depression in older women and DNA methylation for four genes related to anxiety or depression. METHODS: Women aged 65 and older with (n = 19) or without (n = 24) anxiety disorders and/or major depressive episode (DSM-IV), were recruited. DNA methylation and single nucleotide variant (SNV) were evaluated from saliva, respectively by pyrosequencing and by PCR, for the following genes: brain-derived neurotrophic factor (BDNF; rs6265), oxytocin receptor (OXTR; rs53576), serotonin transporter (SLC6A4; rs25531), and apolipoprotein E (APOE; rs429358 and rs7412). RESULTS: A greater BDNF DNA methylation was observed in subjects with anxiety/depression compared to control group subjects (Mean: 2.92 SD ± 0.74 vs. 2.34 ± 0.42; p= 0.0026). This difference was more pronounced in subjects carrying the BDNF rs6265 CT genotype (2.99 ± 0.41 vs. 2.27 ± 0.26; p= 0.0006) than those carrying the CC genotype (p= 0.0332); no subjects with the TT genotype were observed. For OXTR, a greater DNA methylation was observed in subjects with anxiety/depression, but only for those carrying the AA genotype of the OXTR rs53576 SNV, more particularly at one out of the seven CpGs studied (7.01 ± 0.94 vs. 4.44 ± 1.11; p= 0.0063). No significant differences were observed for APOE and SLC6A4. CONCLUSION: These results suggest that DNA methylation in interaction with SNV variations in BDNF and OXTR, are associated with the occurrence of anxiety/depression in older women.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».