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Enregistrement W1555378511 · doi:10.3389/fgene.2015.00230

DNA methylation and single nucleotide variants in the brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and oxytocin receptor (OXTR) genes are associated with anxiety/depression in older women

2015· article· en· W1555378511 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeUniversité LavalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchRéseau québécois de recherche sur le vieillissement
Mots-clésOxytocin receptorOxytocinSingle-nucleotide polymorphismGeneDNA methylationAnxietyGeneticsBrain-derived neurotrophic factorPsychologyNeurotrophic factorsDepression (economics)EpigeneticsTropomyosin receptor kinase BBiologyReceptorNeurosciencePsychiatryGene expressionGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Environmental effects and personal experiences could be expressed in individuals through epigenetic non-structural changes such as DNA methylation. This methylation could up- regulate or down-regulate corresponding gene expressions and modify related phenotypes. DNA methylation increases with aging and could be related to the late expression of some forms of mental disease. The objective of this study was to evaluate the association between anxiety disorders and/or depression in older women and DNA methylation for four genes related to anxiety or depression. METHODS: Women aged 65 and older with (n = 19) or without (n = 24) anxiety disorders and/or major depressive episode (DSM-IV), were recruited. DNA methylation and single nucleotide variant (SNV) were evaluated from saliva, respectively by pyrosequencing and by PCR, for the following genes: brain-derived neurotrophic factor (BDNF; rs6265), oxytocin receptor (OXTR; rs53576), serotonin transporter (SLC6A4; rs25531), and apolipoprotein E (APOE; rs429358 and rs7412). RESULTS: A greater BDNF DNA methylation was observed in subjects with anxiety/depression compared to control group subjects (Mean: 2.92 SD ± 0.74 vs. 2.34 ± 0.42; p= 0.0026). This difference was more pronounced in subjects carrying the BDNF rs6265 CT genotype (2.99 ± 0.41 vs. 2.27 ± 0.26; p= 0.0006) than those carrying the CC genotype (p= 0.0332); no subjects with the TT genotype were observed. For OXTR, a greater DNA methylation was observed in subjects with anxiety/depression, but only for those carrying the AA genotype of the OXTR rs53576 SNV, more particularly at one out of the seven CpGs studied (7.01 ± 0.94 vs. 4.44 ± 1.11; p= 0.0063). No significant differences were observed for APOE and SLC6A4. CONCLUSION: These results suggest that DNA methylation in interaction with SNV variations in BDNF and OXTR, are associated with the occurrence of anxiety/depression in older women.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,308
Score d'incertitude au seuil0,683

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle