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Enregistrement W1555438838 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.884.19

Distinguishing differences between intrinsic aerobic capacity and age: a 1H‐NMR metabolomics approach (884.19)

2014· article· en· W1555438838 sur OpenAlexafffundabout
Jane Shearer, Oluyemi S. Falegan, Russell T. Hepple, Dustin S. Hittel, Lauren G. Koch, Britton Steven, Hans J. Vogel

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Cancer Foundation
Mots-clésMetabolomicsTaurineValineSarcosineAerobic capacityMetabolomeMetaboliteChemistryInternal medicineBiochemistryBiologyMedicineAmino acidBioinformaticsGlycine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Differences in intrinsic aerobic capacity play a critical role in the development of perturbed metabolism, chronic disease and all‐cause mortality. Aims were to employ metabolomics to examine differences in age vs. aerobic capacity in young and old rats selectively bred for low (LCR) or high (HCR) aerobic capacity. Proton nuclear magnetic resonance spectroscopy (1H‐NMR) evaluated the metabolic profile of plasma samples obtained from fasted LCR and HCR. Multivariate statistical analysis was employed, with individual features judged based on variability R2 and predictive ability Q2 in unsupervised and supervised models built using the most significant metabolites. Taurine, pyruvate, acetone, valine, amongst others were key metabolites that contributed to distinct separation based on age (R2=0.83, Q2=0.65). In contrast, weaker predictive models were observed for LCR vs. HCR with scores of R2=0.53 and Q2=0.35 respectively. Key metabolites that decreased in HCR compared to LCR included isopropanol, o‐acetylcarnithine, sarcosine and proline. Pathway analysis highlighted changes in methionine, purine and TCA cycle intermediates. In conclusion, metabolomics analysis was a better predictor and age rather than aerobic capacity in LCR and HCR rats. This observation highlights the importance of age when attempting to isolate metabolic changes in aerobic capacity and their relation to chronic disease risk. Grant Funding Source : Supported by the Alberta Cancer Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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