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Enregistrement W1559015234 · doi:10.7202/013541ar

Waterborne Pathogens: A Critical Assessment of Methods, Results and Data Analysis

2006· article· en· W1559015234 sur OpenAlexafffund
Pierre Payment, Katarina Pintar

Notice bibliographique

RevueRevue des sciences de l eau · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaHealth CanadaInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesUniversity of WaterlooMinistry of EnvironmentHealth CanadaCenters for Disease Control and PreventionUniversity of LethbridgeCanadian Water NetworkUniversity of Ottawa
Mots-clésContext (archaeology)Waterborne diseasesRisk analysis (engineering)OutbreakEnvironmental resource managementEnvironmental healthBiologyEnvironmental planningGeographyBusinessMedicineEnvironmental science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Humans harbour a variety of pathogens that are often transmitted from other animal species. A few are localized in tropical areas, but most enteric pathogens are present everywhere on the planet and they travel with their hosts to distant locations. Several of these microorganisms are transmitted by water that has been contaminated by fecal matter, whereas some are normally found in water but, given an opportunity, will cause disease (i.e., opportunistic pathogens). While waterborne outbreaks have been reported for many pathogens, assessing the proportion of the disease burden to a specific route and pathogen has proven quite elusive. Surveillance of disease in populations, even when actively done, is very inaccurate as it often gathers data on the most acute cases that are only a very small proportion of the true number of infected individuals. There are several issues discussed herein, focusing on the needs and gaps linked to waterborne pathogen monitoring. The benefits and weaknesses of current and emerging methodologies are discussed, in addition to the appropriateness of allocating resources to waterborne pathogen monitoring. The most critical gap is the lack of validation of most methods used in environmental microbiology for the detection of pathogens. Data generated by various laboratories are currently extremely difficult to compare and cannot serve as the basis for risk assessment or management. The issue of laboratory capacity is also raised, within the context of the availability of trained personnel, the application of QA/QC protocols, and accreditation on a national level. In closing, needs are identified for informed communication of the risks of waterborne pathogens, the training of highly qualified personnel, and the development and standardization of methods that will ultimately enhance water safety and public health protection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,820
Score d'incertitude au seuil0,438

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,155
Tête enseignante GPT0,489
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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