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Enregistrement W1560588280 · doi:10.1002/cncr.28933

Performance characteristics of screening strategies for Lynch syndrome in unselected women with newly diagnosed endometrial cancer who have undergone universal germline mutation testing

2014· article· en· W1560588280 sur OpenAlexaffabout
Sarah E. Ferguson, Melyssa Aronson, Aaron Pollett, Lua Eiriksson, Amit M. Oza, Steven Gallinger, Jordan Lerner‐Ellis, Zahra Alvandi, Marcus Q. Bernardini, Helen Mackay, Golnessa Mojtahedi, Alicia Tone, Christine Massey, Blaise Clarke

Notice bibliographique

RevueCancer · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMcMaster UniversityJuravinski HospitalMount Sinai HospitalPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesPrincess Margaret Hospital Foundation
Mots-clésLynch syndromeMSH6Microsatellite instabilityMedicineMSH2MLH1Germline mutationEndometrial cancerFamily historyGenetic testingOncologyInternal medicineCancerGynecologyMutationDNA mismatch repairGeneticsBiologyColorectal cancerMicrosatellite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Immunohistochemistry (IHC) for mismatch repair protein expression, microsatellite instability (MSI) testing, tumor morphology, and family history were compared to determine which screening strategy is superior in identifying Lynch syndrome (LS) in unselected women with newly diagnosed endometrial cancer (EC) who have undergone universal germline mutation testing. METHODS: A prospective cohort study was performed that recruited women with newly diagnosed EC. Participants completed a family history assessment with molecular characterization of EC with IHC and MSI testing and EC assessment for LS-associated morphologic features and underwent universal germline mutation testing for mutations in the mismatch repair pathway. The sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values were compared between the screening strategies. RESULTS: A total of 118 (65%) of 182 consecutive women with EC participated. Of these, 34 women (29%) had tumors that were IHC deficient and 27 women (23%; N = 117) had tumors that were positive for MSI. Twenty women (17%) met IHC criteria and 16 women (15.2%, N = 105) met family history criteria based on Ontario Ministry of Health Criteria for the genetic assessment for LS. Seven women (5.9%) had a germline mutation: 4 had MLH1 (mutL homolog 1), 2 had MSH6 (mutS homolog 6), and 1 had MSH2 (mutS homolog 2). IHC in women aged <60 years had the best performance characteristics, with a sensitivity of 100%, a specificity of 86.1%, a positive predictive value of 58.3%, and a negative predictive value of 100%. Family history and tumor morphology both had the lowest sensitivity at 71.4%. Overall tumor morphology had the poorest performance, with a specificity of 42.1%. CONCLUSIONS: The mutation rate of 5.9% was higher than expected in this unselected cohort of women with EC. The superior screening strategy to identify women presenting with EC is universal IHC screening in women aged <60 years.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,201
Score d'incertitude au seuil0,838

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations141
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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