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Enregistrement W1560958935 · doi:10.1111/j.1365-2567.2011.03538.x

Fine epitope mapping within the pathogenic thyroglobulin peptide 2340–2359: minimal epitopes retaining antigenicity across various MHC haplotypes are not necessarily immunogenic

2011· article· en· W1560958935 sur OpenAlexaff
Aikaterini Hatzioannou, Maria Alevizaki, George Carayanniotis, Peggy Lymberi

Notice bibliographique

RevueImmunology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesGeneral Secretariat for Research and Technology
Mots-clésEpitopeBiologyAntigenicityThyroglobulinMajor histocompatibility complexAntigenPeptideEpitope mappingAmino acidSubdominantPeptide sequenceMolecular biologyGeneticsAntibodyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously reported that the 20-mer peptide p2340 (amino acids 2340-2359), of human thyroglobulin (Tg) has the unique feature that it causes experimental autoimmune thyroiditis (EAT) in mouse strains bearing high-responder (HR) or low-responder (LR) MHC haplotypes in Tg-induced EAT. In this study, we have employed fine epitope mapping to examine whether this property of p2340 is the result of recognition of distinct or shared minimal T-cell epitopes in the context of HR or LR MHC class II molecules. Use of overlapping peptides showed that a core minimal 9-mer epitope (LTWVQTHIR, amino acids 2344-2352) was recognized by p2340-primed T cells from both HR (H2(k,s) ) and LR (H2(b,d) ) strains, whereas a second 9-mer epitope (HIRGFGGDP, amino acids 2350-2358) was antigenic only in H2(s) hosts. Truncation analysis of LTWVQTHIR and HIRGFGGDP peptides delineated them as the minimal epitopes recognized by p2340-primed T cells from the above strains. Subcutaneous challenge of all mouse strains with the 9-mer core peptide LTWVQTHIR in adjuvant elicited specific lymph node cell proliferative responses and mild EAT only in HR hosts, highlighting this sequence as a minimal pathogenic Tg peptide in EAT. The 9-mer peptide HIRGFGGDP was not found to be immunogenic in H2(s) hosts. These data demonstrate that minimal T-cell epitopes, defined as autoantigenic in hosts of various MHC haplotypes, are not intrinsically immunogenic. Activation of naive autoreactive T cells may require contributions from flanking residues within longer peptide sequences encompassing these epitopes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesÉtudes des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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