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Enregistrement W1562486943 · doi:10.1111/j.1365-3180.2010.00804.x

Low genetic variability of<i>Striga gesnerioides</i>populations parasitic on cowpea might be explained by a recent origin

2010· article· en· W1562486943 sur OpenAlexafffund
M‐P DUBE, François Belzile

Notice bibliographique

RevueWeed Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésStrigaBiologyAmplified fragment length polymorphismScrophulariaceaeObligateGenetic variabilityPopulationCultivarParasitic plantGenetic variationBotanyAgronomyGenetic diversityHost (biology)GenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DubeM‐P & BelzileFJ (2010). Low genetic variability ofStriga gesnerioidespopulations parasitic on cowpea might be explained by a recent origin.Weed Research50, 493–502. Summary Striga gesnerioidesis an obligate root hemiparasitic plant that causes considerable yield losses to cowpea, an important crop legume of Sub‐Saharan Africa. The use of resistant cultivars is the easiest and most effective method to control the parasite. Several cowpea cultivars exhibiting resistance have been identified during the last decades. However, most resistant cultivars show a differential response when grown in different countries across West Africa, suggesting that there are different races ofS. gesnerioides. In this study, we investigated the genetic variability within and between 43 populations of five of the previously recognised races of the parasite present in West Africa. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers were used on up to 10 individuals from each population. These markers showed almost no genetic variability within populations. The variability between the populations was also extremely low and did not allow discrimination of the five races. There was a certain geographical structure, but no ‘racial’ clustering could be seen. Even AFLP markers previously reported to be race‐specific on another set ofStrigapopulations proved unable to discriminate between races in this collection of populations. Possible causes of the low level of genetic variability include the hypothesis that this strain has only quite recently arisen. Such a low level of variability and the absence of specific markers for the virulence will have consequences on the evolution of the parasite and on the development of adequate control methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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