Low genetic variability of<i>Striga gesnerioides</i>populations parasitic on cowpea might be explained by a recent origin
Notice bibliographique
Résumé
DubeM‐P & BelzileFJ (2010). Low genetic variability ofStriga gesnerioidespopulations parasitic on cowpea might be explained by a recent origin.Weed Research50, 493–502. Summary Striga gesnerioidesis an obligate root hemiparasitic plant that causes considerable yield losses to cowpea, an important crop legume of Sub‐Saharan Africa. The use of resistant cultivars is the easiest and most effective method to control the parasite. Several cowpea cultivars exhibiting resistance have been identified during the last decades. However, most resistant cultivars show a differential response when grown in different countries across West Africa, suggesting that there are different races ofS. gesnerioides. In this study, we investigated the genetic variability within and between 43 populations of five of the previously recognised races of the parasite present in West Africa. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers were used on up to 10 individuals from each population. These markers showed almost no genetic variability within populations. The variability between the populations was also extremely low and did not allow discrimination of the five races. There was a certain geographical structure, but no ‘racial’ clustering could be seen. Even AFLP markers previously reported to be race‐specific on another set ofStrigapopulations proved unable to discriminate between races in this collection of populations. Possible causes of the low level of genetic variability include the hypothesis that this strain has only quite recently arisen. Such a low level of variability and the absence of specific markers for the virulence will have consequences on the evolution of the parasite and on the development of adequate control methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».