Computational modeling of genetic processes in stichotrichous ciliates
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
This thesis concerns itself primarily with the study of the process of gene unscrambling in stichotrichous ciliates as a computational model. We begin by presenting an in vitro model of DNA computing, based on circular insertions and deletions, that serves as part of the basis for one of the investigated models of gene descrambling in ciliates. This work has also been published as Circular contextual insertion/deletion with applications to biomolecular computation [17]. We next proceed to analyze the bio-operations proposed by two models of this computational biological process from the point of view of formal language theory. We consider the closure properties of various families of languages under these operations, the solvability of language equations involving these operations and some additional abstract properties of the operations. The results given here have also appeared as Some properties of ciliate bio-operations [16], Closure and decidability properties of some language classes with respect to ciliate bio-operations [14] and The ld and dlad bio-operations on formal languages [15]. We then present an algorithm to determine the relative complexity of scrambled genes by finding minimal descrambling paths. We include not only a theoretical description of this technique, but also the results of applying it to real ciliate genes. Finally, we consider the relative time-complexities of the proposed models of gene descrambling.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle