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Enregistrement W1569444286 · doi:10.1038/cddis.2015.102

Peptides derived from the dependence receptor ALK are proapoptotic for ALK-positive tumors

2015· article· en· W1569444286 sur OpenAlexaff
Arthur Aubry, Stéphane Galiacy, Laurie Ceccato, Cynthia Marchand, Cyrielle Tricoire, Frédéric Lopez, Rod Bremner, Claire Racaud‐Sultan, Bernard Monsarrat, François Malecaze, M Allouche

Notice bibliographique

RevueCell Death and Disease · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesFondation de FranceInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésAnaplastic lymphoma kinaseCancer researchNeuroblastomaApoptosisTyrosine kinaseALK inhibitorMolecular biologyCrizotinibBiologyReceptor tyrosine kinaseCell cultureKinaseCytotoxic T cellChemistrySignal transductionCell biologyBiochemistryMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ALK is a receptor tyrosine kinase with an oncogenic role in various types of human malignancies. Despite constitutive activation of the kinase through gene alterations, such as chromosomal translocation, gene amplification or mutation, treatments with kinase inhibitors invariably lead to the development of resistance. Aiming to develop new tools for ALK targeting, we took advantage of our previous demonstration identifying ALK as a dependence receptor, implying that in the absence of ligand the kinase-inactive ALK triggers or enhances apoptosis. Here, we synthesized peptides mimicking the proapoptotic domain of ALK and investigated their biological effects on tumor cells. We found that an ALK-derived peptide of 36 amino acids (P36) was cytotoxic for ALK-positive anaplastic large-cell lymphoma and neuroblastoma cell lines. In contrast, ALK-negative tumor cells and normal peripheral blood mononuclear cells were insensitive to P36. The cytotoxic effect was due to caspase-dependent apoptosis and required N-myristoylation of the peptide. Two P36-derived shorter peptides as well as a cyclic peptide also induced apoptosis. Surface plasmon resonance and mass spectrometry analysis of P36-interacting proteins from two responsive cell lines, Cost lymphoma and SH-SY5Y neuroblastoma, uncovered partners that could involve p53-dependent signaling and pre-mRNA splicing. Furthermore, siRNA-mediated knockdown of p53 rescued these cells from P36-induced apoptosis. Finally, we observed that a treatment combining P36 with the ALK-specific inhibitor crizotinib resulted in additive cytotoxicity. Therefore, ALK-derived peptides could represent a novel targeted therapy for ALK-positive tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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