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Enregistrement W1572226852 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.lb67

Phosphoenolpyruvate Carboxykinase: Possible Therapeutic Targets for Insulin Resistant Type‐II Diabetes

2015· article· en· W1572226852 sur OpenAlexaff
Susan M. Wall, Jonathan Chow, Justin S. Huang, Amanda Yang, Kyra Jones

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphoenolpyruvate carboxykinaseGluconeogenesisGTP'Glucose homeostasisChemistryEnzymeGlucagonBiochemistryInsulinBiophysicsBiologyEndocrinologyInsulin resistanceHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maintaining blood glucose levels is not just the responsibility of insulin and glucagon but also of a rate‐controlling enzyme known as Phosphoenolpyruvate Carboxykinase (PEPCK). This molecule plays a central role in glucose homeostasis by controlling hepatic gluconeogenesis. Developing functional inhibitors of PEPCK would be useful in the treatment of diabetes and the model of PEPCK reveals several sites of interest. Cytosolic, mammalian PEPCK is a GTP‐dependent enzyme that catalyzes the rate‐controlling step in gluconeogenesis: conversion of oxaloacetate to phosphoenolpyruvate. Two divalent metal ions are required for enzyme activity. The positively charged active site creates an electrostatic environment tailored to stabilize the localized negative charge of the enzyme's substrates. There is no consensus on the order in which substrates bind but upon binding, a mobile lid domain (Ω‐loop) closes, causing the substrates to be positioned closer to one another. Only upon closure of the lid, does another structural feature, the P‐loop, move which repositions the GTP molecule. Finally, the N‐ and C‐terminal lobes move inward, All of these steps are required for catalysis to occur and so are possible targets for the inactivation of PEPCK. The Ashbury College SMART team (Students Modeling A Research Topic) used Jmol interactive software and 3D printed using Zcorp plaster modeling to create PEPCK.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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