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Enregistrement W1572496322 · doi:10.1089/107999002753452638

Review: IRF Regulation of HIV-1 Long Terminal Repeat Activity

2002· review· en· W1572496322 sur OpenAlexafffund
Angela Battistini, Giulia Marsili, Marco Sgarbanti, Barbara Ensoli, John Hiscott

Notice bibliographique

RevueJournal of Interferon & Cytokine Research · 2002
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchIstituto Superiore di Sanità
Mots-clésTerminal (telecommunication)Long terminal repeatHuman immunodeficiency virus (HIV)BiologyComputational biologyGeneticsVirologyComputer scienceGeneTelecommunicationsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interferon (IFN) regulatory factors (IRF) constitute a family of transcriptional activators and repressors implicated in multiple biologic processes, including regulation of immune responses and host defense, cytokine signalling, cell growth regulation, and hematopoietic development. All members are characterized by well-conserved DNA binding domains at the N-terminal region that recognize similar DNA sequences termed IRF-binding element/IFN-stimulated response element (IRF-E/ISRE) present on the promoter of the IFN-alpha/beta genes and of some IFN-stimulated genes (ISG). Recently, a sequence homologous to the ISRE has been identified downstream of the 5' human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) long terminal repeat (LTR). This sequence is a binding site for IRF-1 and IRF-2. Deletion of the LTR-ISRE results in impaired LTR promoter activity and decreased synthesis of viral RNA and proteins. Here, we briefly summarize characteristics of IRF-1 and IRF-2 binding to the HIV-1 LTR-ISRE and the data obtained to date on the functionality of this cis-element and on the role of IRF in the regulation of HIV-1 LTR transcriptional activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,819
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,124
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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