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Enregistrement W1572970616 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.1133.1

Structural characterization of mixed wt/mutant aquaporin‐2 tetramers using dual‐colored fluorescent subunit counting (1133.1)

2014· article· en· W1572970616 sur OpenAlexaff
Yoann Lussier, Hugo McGuire, Abdulah El Tarazi, Pierre Bissonnette, Rikard Blunck, Daniel G. Bichet

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensHôpital du Sacré-Cœur de MontréalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTetramerMutantNephrogenic diabetes insipidusProtein subunitXenopusAquaporin 2ReabsorptionChemistryHEK 293 cellsFluorescenceImmunoprecipitationWild typeMolecular biologyCell biologyMutationTransfectionGreen fluorescent proteinBiophysicsBiologyGeneKidneyBiochemistryGeneticsEnzymePhysicsWater channel

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in Aquaporin‐2 (AQP2) induce nephrogenic diabetes insipidus, a water reabsorption defect of the kidney. Using co‐immunoprecipitation and functional assays, we have recently shown that (at least) some mild recessive (rec) AQP2 mutants can adequately associate to its wild‐type (wt) counterpart to generate fully functional wt/rec heterotetramers. To better characterize actual subunit distributions within wt/rec AQP2 populations, we have developed a dual‐colored fluorescent subunit counting approach in TIRF condition, in order to identify and quantify individual monomers through bleaching of linked fluorophores. Assays performed on both Xenopus oocyte and transfected cell line have confirmed that mild mutations (K228E, D150E and V24A), similar to wt‐AQP2, adequately oligomerize in tetramer, unlike the severe R187C mutant which only displays monomeric structures. In dual transfections (sfGFP‐wt‐AQP2 + RFP‐rec‐AQP2), we also confirm the presence of mixed wt/rec tetramers for mild mutations, but not with R187C, which remains monomeric. Ultimately, we aim at describing subunit distributions within wt/rec tetramers in order to evaluate the properties, limitations and functional outcome of such heteromeric associations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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