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Enregistrement W1574323862 · doi:10.5376/mpb.2014.05.0010

Deep Sequencing of the Pistil Transcriptome in the Cross Incompatible Maize

2014· article· en· W1574323862 sur OpenAlexvenueno aff
Song Li, Chunyan Xu, Dezhou Cui, Huaihua Liu, Peng Li, Hua Zhang, Detao Li, Youhui Tian, Huabang Chen, Xianrong Zhao

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTranscriptomeGynoeciumGeneticsDNA sequencingGeneComputational biologyBotanyStamenGene expressionPollen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant reproductive development is dependent on successful pollen-pistil interactions. The high degree of specificity in pollen-pistil interactions and the precision of directional pollen tube growth suggest that signals are continually being exchanged between pollen tubes and cells of the pistil that line their path. However, with few exceptions, little is known about the genes that control these interactions. In this investigation, we performed genome-wide transcriptional profiling of pistil tissues of Gametophytic factor1-Strong (Ga1-S) genotype maize after pollination 5 hours(5HAP)with Ga1-S pollen and ga1 pollen respectively , in an attempt to isolate genes involved in pollen tube elongation in maize pistils, using the Solexa deep sequencing technology. The results of this study suggest that the regulation of reinforcing, modifying, or remodeling the structure of the transmitting tract and the pollen tube tip play a critical role in pollen-pistil interactions during pollen tube elongation in maize pistils, and the inhibition of these functions maybe the molecular mechanism of how Gametophytic factor1-Strong (Ga1-S) presence in style tissue completely prevents ga1 pollen to accomplish fertilization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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