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Enregistrement W1584199746 · doi:10.1111/j.1529-8817.2010.00881.x

SIDEROPHORE-INDEPENDENT IRON UPTAKE BY IRON-LIMITED CELLS OF THE CYANOBACTERIUM ANABAENA FLOS-AQUAE1

2010· article· en· W1584199746 sur OpenAlexaff
Nikki L. Wirtz, Ron G. Treble, Harold G. Weger

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSiderophoreCyanobacteriaChelationBiologyAnabaenaFerritinBiochemistryEthylenediamineBacteriaChemistryInorganic chemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iron acquisition by iron-limited cyanobacteria is typically considered to be mediated mainly by siderophores, iron-chelating molecules released by iron-limited cyanobacteria into the environment. In this set of experiments, iron uptake by iron-limited cells of the cyanobacterium Anabaena flos-aquae (L.) Bory was investigated in cells resuspended in siderophore-free medium. Removal of siderophores decreased iron-uptake rates by ∼60% compared to siderophore-replete conditions; however, substantial rates of iron uptake remained. In the absence of siderophores, Fe(III) uptake was much more rapid from a weaker synthetic chelator [N-(2-hydroxyethyl)ethylenediamine-N,N′,N′-triacetic acid (HEDTA); log Kcond = 28.64 for Fe(III)HEDTA(OH)−] than from a very strong chelator [N,N′-bis(2-hydroxybenzyl)-ethylenediamine-N,N′-diacetic acid (HBED); log Kcond = 31.40 for Fe(III)HBED−], and increasing chelator:Fe(III) ratios decreased the Fe(III)-uptake rate; these results were evident in both short-term (4 h; absence of siderophores) and long-term (116 h; presence of siderophores) experiments. However, free (nonchelated) Fe(III) provided the most rapid iron uptake in siderophore-free conditions. The results of the short-term experiments are consistent with an Fe(III)-binding/uptake mechanism associated with the cyanobacterial outer membrane that operates independently of extracellular siderophores. Iron uptake was inhibited by temperature-shock treatments of the cells and by metabolically compromising the cells with diphenyleneiodonium; this finding indicates that the process is dependent on active metabolism to operate and is not simply a passive Fe(III)-binding mechanism. Overall, these results point to an important, siderophore-independent iron-acquisition mechanism by iron-limited cyanobacterial cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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