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Enregistrement W1588741472 · doi:10.1111/jse.12080

Molecular phylogeny revealed complex evolutionary process in<i>Elymus</i>species

2014· article· en· W1588741472 sur OpenAlexaff
Genlou Sun

Notice bibliographique

RevueJournal of Systematics and Evolution · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensSaint Mary's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElymusTriticeaeBiologyIntrogressionPhylogeneticsPhylogenetic treeGenomeEvolutionary biologyBotanyGeneticsGenePoaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Recent molecular phylogenetic studies onElymushave added to our understanding of the origination ofElymusspecies. However, evolutionary dynamics and speciation of most species inElymusare unclear. Molecular phylogeny has demonstrated that reticulate evolution has occurred extensively in the genus, as an example, the largest subunit of RNA polymerase II (rpb2) and phosphoenolpyruvate carboxylase (pepC) data revealed two versions of theStgenome,St1andSt2contributing to speciation ofE. caninus. Phylogenetic analyses ofE. pendulinusuncovered additional genome‐level complexity. Our data indicated that both chloroplast and nuclear gene introgression have occurred in the evolutionary process ofE. pendulinus. Non‐donor species genomes have been detected in severalElymusspecies, such as in allohexaploidE. repens(StStStStHH), aTaeniatherum‐like (Tagenome in Triticeae) GBSSI sequence,Bromus‐ (Bromeae) andPanicum‐like (Paniceae) ITS sequences have been detected. The chloroplast DNA data indicated thatPseudoroegneriais the maternal genome donor toElymusspecies, but whether differentElymusspecies originated from differentStdonors remains an open question. The origin of theYgenome inElymusis puzzling. It is clear that theYgenome is distinct from theStgenome, but unclear on the relationships ofYto other genomes in Triticeae. Introgressive hybridization may be an important factor complicating the evolutionary history of the species inElymus. The extent of introgression and its role in creating diversity inElymusspecies should be the objective of further investigations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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