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Enregistrement W1589453135 · doi:10.1186/1897-4287-10-s2-a33

Substantial unexplained variation in cancer risks for MLH1 and MSH2 mutation carriers

2012· article· en· W1589453135 sur OpenAlexaff
JG Dowty, Aung Ko Win, Daniel D. Buchanan, Robert J. MacInnis, Noralane M. Lindor, SN Thibodeau, Graham Casey, Steven Gallinger, Polly A. Newcomb, Robert W. Haile, Jack Goldblatt, S Parry, FA Macrae, JL Hopper, Mark A. Jenkins

Notice bibliographique

RevueHereditary Cancer in Clinical Practice · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMLH1PenetranceProbandFamily historyCancerMSH2Colorectal cancerPopulationOncologyInternal medicineMutationGeneticsEnvironmental healthDNA mismatch repairGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline mutations in the DNA mismatch repair genes MLH1 and MSH2 are associated with substantially increased risks of colorectal cancer (CRC), endometrial cancer (EC) and certain other cancers. Due to the rarity of these mutations, previous studies have been underpowered to provide precise estimates of risks. We studied 167 MLH1 and 225 MSH2 mutation-carrying families comprising 17,352 members from the Colon Cancer Family Registry. Probands were recruited either because they had a family history of cancer (n=274) or from cancer registries independently of family history (n=118). Hazard ratios (HRs) of cancer risks for carriers compared with the general population and age-specific cumulative risks for carriers (penetrance) were estimated using modified segregation analysis conditioned on ascertainment. Heterogeneity in risks for carriers was modelled with a polygenic risk modifier (as in the BOADICEA model). The age-specific incidence of CRC for male MLH1 mutation carriers was estimated to be 222 times (95% CI: 152-324) that for the population at ages 40 years and younger but only 6.1 times higher (95% CI: 2.4-15.5) after age 60 years. This decline (p<0.0001) in the CRC HR with age was also evident for female MLH1 mutation carriers (p=0.002) but was less marked. Male MLH1 mutation carriers on average had higher CRC HRs than female carriers (p=0.004). The estimated CRC HRs for MSH2 mutation carriers were similar to those for MLH1 , with any differences consistent with chance (p>0.3). The estimated EC HRs also decreased sharply with age (p=0.0004 and 0.001 for MLH1 and MSH2 , respectively) and no difference by gene was observed (p=0.7). There was strong evidence for an unmeasured polygenic modifier of risk (p<0.0001). The estimated average cumulative risks (95% CI) of CRC to age 70 years were 44% (35-54) for male carriers and 38% (30-48) for female carriers, and corresponding EC risks were 22% (14-31). However for carriers in the lowest vs. highest quartiles of polygenic risk (respectively) these were 4.9% vs. 93% for male CRC, 3.5% vs. 88% for female CRC and 1.5% vs. 59% for EC. This international study shows that, although the average cancer risks for MLH1 and MSH2 mutation carriers are similar, there is substantial unexplained variation in risks due to differences by mutation or by genetic or environmental modifiers. This finding has implications for the counselling and clinical management of mutation carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,126
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,483
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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