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Enregistrement W1590680891 · doi:10.1111/j.1747-0285.2010.00970.x

Computational Design and Biological Testing of Highly Cytotoxic Colchicine Ring A Modifications

2010· article· en· W1590680891 sur OpenAlexafffund
J. Torin Huzil, Philip Winter, Lorelei Johnson, Alexander L. Weis, Tamas Bakos, Asok Banerjee, Richard F. Ludueña, Sambasivarao Damaraju, Jack A. Tuszyński

Notice bibliographique

RevueChemical Biology & Drug Design · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAllard Foundation
Mots-clésColchicineTubulinPaclitaxelCytotoxicityMicrotubuleComputational biologyChemistryBiologyBiochemistryIn vitroCell biologyCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microtubules are the primary target for many anti-cancer drugs, the majority of which bind specifically to beta-tubulin. The existence of several beta-tubulin isotypes, coupled with their varied expression in normal and cancerous cells provides a platform upon which to construct selective chemotherapeutic agents. We have examined five prevalent human beta-tubulin isotypes and identified the colchicine-binding site as the most promising for drug design based on specificity. Using this binding site as a template, we have designed several colchicine derivatives and computationally probed them for affinity to the beta-tubulin isotypes. These compounds were synthesized and subjected to cytotoxicity assays to determine their effectiveness against several cancerous cell lines. We observed a correlation between computational-binding predictions and experimentally determined IC(50) values, demonstrating the utility of computational screening in the design of more effective colchicine derivatives. The most promising derivative exhibited an IC(50) approximately threefold lower than values previously reported for either colchicine or paclitaxel, demonstrating the utility of computational design and assessment of binding to tubulin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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