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Enregistrement W1601534759 · doi:10.1111/jfb.12553

Measures of immune system status in young‐of‐the‐year winter flounder<i>Pseudopleuronectes americanus</i>

2015· article· en· W1601534759 sur OpenAlexaff
J. S. Romany, Anne E. McElroy, Mark D. Fast

Notice bibliographique

RevueJournal of Fish Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesNew York State Department of Environmental Conservation
Mots-clésWinter flounderBiologyFlounderZoologyFisheryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The immune status of young-of-the-year (YOY) winter flounder Pseudopleuronectes americanus was evaluated in fish collected from six areas around Long Island, NY, U.S.A. representing more urban areas with high population density in the west, to less densely populated more rural areas in to the east. Gene expression markers for innate immunity (pleurocidin) and contaminant exposure (cytochrome P4501A; cyp1a) were measured in liver and fin of fish collected at each site. Expression of pleurocidin was significantly higher in fin than liver, but was highly variable among individuals. Some statistically significant differences in pleurocidin expression among sites were observed, although elevated levels were not associated with degree of urbanization. Expression was related in part to fish size: a positive correlation between expression and total length (LT ) of fish was observed with the largest LT class (>125 mm) exhibiting significantly elevated pleurocidin expression as compared with fish in the smaller LT class. This indicates that immune competency may increase with age. No site-specific differences in cyp1a expression were observed. These data suggest that exposure to aromatic hydrocarbon contaminants is fairly widespread throughout the study area and that any differences in pleurocidin expression in YOY P. americanus are probably due to other factors. Antimicrobial activity was also measured as a functional indicator of immune response. Activity was highly variable, showing no significant site-specific differences, and no significant correlation to pleurocidin expression. The lack of correlation between pleurocidin expression and antimicrobial activity indicates that other antimicrobial peptides may be active against the bacteria tested or that other factors are influencing antimicrobial activity. This is the first quantitative evaluation of pleurocidin expression in YOY P. americanus from an urban area. Further work is needed to characterize factors controlling pleurocidin expression, as well as other indicators of immune response in young fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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