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Enregistrement W1601555021 · doi:10.1002/humu.22811

A Mitochondrial Translation Defect Identified by Whole-Exome Sequencing Expands the Phenotypic Spectrum for<i>MARS2</i>

2015· article· en· W1601555021 sur OpenAlexaboutno aff
Michael F. Wangler, Vafa Bayat, Hugo J. Bellen

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesTarget ALSRobert A. and Renee E. Belfer Family FoundationNational Institute of Neurological Disorders and StrokeHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyGeneticsExomeExome sequencingMitochondrial DNAMissense mutationPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mitochondrial genome encodes 13 proteins of the Electron Transport Chain. This genome requires nuclear-encoded proteins for its maintenance, replication, transcription and translation. A growing list of disorders ranging from ovarian dysgenesis, pulmonary hypertension and neurodegeneration have been found to result from mutations in mitochondrial aminoacyl-tRNA synthetases required for mitochondrial translation. Complex duplications of the MARS2 locus have previously been reported in French Canadian individuals with autosomal recessive spastic ataxia with leukoencephalopathy (ARSAL) (Bayat et al., PLOS Biology 10(3): e1001288, 2012). Webb et al. (Hum Mutat 36:587–592, 2015) now report missense mutations in the MARS2 gene through whole exome sequencing of two siblings with a severe earlier onset “ARSAL-like” condition, suggestive of a phenotypic expansion for MARS2. Besides the neurologic features, the siblings display a marked pectus carinatum, dysmorphic features and growth failure. Interestingly, they lack ataxic features although they are younger than ARSAL patients. The clinical feature of growth failure, besides being related to low levels of growth hormone, may also be related to lower overall proliferation rates, similar to what was reported by Bayat et al. in studies of MARS2 mutant flies and ARSAL patient cell lines. Importantly, the authors demonstrate mutations in both siblings and rule out other candidates through exome filtering and mtDNA analysis. Further supporting the role of defective mitochondrial translation, they demonstrate Complex I and IV dysfunction in patient fibroblasts and find reduced protein levels of NDUFB8 and COXII, defects that they can rescue with MARS2 expression. This study expands the phenotype related to MARS2, demonstrates distinct phenotypes resulting from point mutations vs. the previously reported complex duplications, and underscores the importance of mitochondrial tRNA synthetases as key candidate genes for a range of phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,171
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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