The regulation of the cell surface proteome by AMP‐activated protein kinase (604.5)
Notice bibliographique
Résumé
The many proteins at the cell surface (collectively, the cell surface proteome) control numerous cellular functions. The amount of each protein at the cell surface is dynamically controlled by endocytosis and recycling. AMP‐activated protein kinase (AMPK) is an important metabolic regulator that responds to energetic stress, such as increased cellular AMP:ATP and certain hormones. Studies examining a small number of cell surface proteins suggest that AMPK may have an important role in regulating endomembrane traffic. How AMPK may more broadly regulate the cell surface proteome is not known. We have refined a method to isolate the cell surface proteome from cultured cells, involving biotinylation of surface‐exposed proteins in intact cells and purification of biotinylated proteins, which we coupled to quantitative mass spectrometry to identify novel AMPK‐regulated membrane traffic phenomena. We find that activation of AMPK results in a decrease in the cell surface abundance of the β1‐integrin, revealing a mechanism by which cellular metabolism may regulate cell adhesion and migration. Our results provide novel insight into the regulation of the cell surface proteome by metabolic stress signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».