The pioneer factor PBX1 is a novel driver of metastatic progression in ERα-positive breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
// Luca Magnani 1 , Darren K. Patten 1 , Van T.M. Nguyen 1 , Sung-Pil Hong 1 , Jennifer H. Steel 1 , Naina Patel 1 , Ylenia Lombardo 1 , Monica Faronato 1 , Ana R. Gomes 1 , Laura Woodley 1 , Karen Page 2 , David Guttery 2 , Lindsay Primrose 2 , Daniel Fernandez Garcia 2 , Jacqui Shaw 2 , Patrizia Viola 3 , Andrew Green 4 , Christopher Nolan 4 , Ian O. Ellis 4 , Emad A. Rakha 4 , Sami Shousha 1 , Eric W.-F. Lam 1 , Balázs Győrffy 5 , Mathieu Lupien 6, 7 , R. Charles Coombes 1 1 Department of Surgery and Cancer, Imperial College London, London, UK 2 Department of Cancer Studies, University of Leicester, Leicester, UK 3 Laboratory of Medicine, Histopathology Department, Royal Brompton Hospital, London, UK 4 Division of Cancer and Stem Cells, School of Medicine, University of Nottingham, Budapest, HU 5 MTA TTK Lendület Cancer Biomarker Research Group; 2nd Department of Pediatrics, Semmelweis University and MTA-SE Pediatrics and Nephrology Research Group, Budapest, HU 6 The Princess Margaret Cancer Centre, University Health Network, Toronto, ON, Canada 7 Department of Medical Biophysics, University of Toronto, Toronto, ON, Canada Correspondence to: Luca Magnani, e-mail: l.magnani@imperial.ac.uk Keywords: breast cancer, estrogen receptor, drug resistance, metastasis, pioneer factors Received: February 18, 2015 Accepted: June 02, 2015 Published: June 15, 2015 ABSTRACT Over 30% of ERα breast cancer patients develop relapses and progress to metastatic disease despite treatment with endocrine therapies. The pioneer factor PBX1 translates epigenetic cues and mediates estrogen induced ERα binding. Here we demonstrate that PBX1 plays a central role in regulating the ERα transcriptional response to epidermal growth factor (EGF) signaling. PBX1 regulates a subset of EGF-ERα genes highly expressed in aggressive breast tumours. Retrospective stratification of luminal patients using PBX1 protein levels in primary cancer further demonstrates that elevated PBX1 protein levels correlate with earlier metastatic progression. In agreement, PBX1 protein levels are significantly upregulated during metastatic progression in ERα-positive breast cancer patients. Finally we reveal that PBX1 upregulation in aggressive tumours is partly mediated by genomic amplification of the PBX1 locus. Correspondingly, ERα-positive breast cancer patients carrying PBX1 amplification are characterized by poor survival. Notably, we demonstrate that PBX1 amplification can be identified in tumor derived-circulating free DNA of ERα-positive metastatic patients. Metastatic patients with PBX1 amplification are also characterized by shorter relapse-free survival. Our data identifies PBX1 amplification as a functional hallmark of aggressive ERα-positive breast cancers. Mechanistically, PBX1 amplification impinges on several critical pathways associated with aggressive ERα-positive breast cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».