Engineering <i>Escherichia coli</i> for D-Ribose Production from Glucose-Xylose Mixtures
Notice bibliographique
Résumé
D-ribose is a commercially important functional sugar used as a nutritional supplement and as a starting compound in the synthesis of antiviral drugs. In this study, we report engineered Escherichia coli mutants that can produce D-ribose from glucose and xylose. Two endogenous haloacid dehalogenase-like (HAD) phosphatases from E. coli, HAD12 and HAD13, encoded by the genes ybiV and yidA, respectively, were expressed in E. coli wild type and the glucose-xylose co-utilizing mutant LMSE2. All the mutants constructed in this study produced D-ribose. The mutant RB-006 (LMSE2 expressing ybiV) showed the highest D-ribose titer of 1.16 g/L from 5 g/L each of glucose and xylose. Additionally, using xylose feeding, D-ribose titer was improved to 3.36 g/L. Xylulose and acetate were formed as the major byproducts in the fed-batch study. This study represents the first example of engineered E. coli for production of D-ribose. This study also demonstrates reengineering of a glucose-xylose co-utilizing mutant of E. coli for production of a valuable chemical.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».