MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1623327531

Expression of β-catenin, CDX1 and CDX2 in esophageal adenocarcinoma: association with survival after esophageal resection

2006· article· en· W1623327531 sur OpenAlexaff
Lara Williams, Laurette Geldenhuys, Nadine Vaninetti, Duane L. Guernsey, Alan G. Casson

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryWnt signaling pathwayCateninCDX2AdenocarcinomaBiologyMessenger RNABeta-cateninCancer researchBarrett's esophagusPathogenesisPathologyEsophageal diseaseSurvival analysisEsophagusMedicineInternal medicineGene expressionSignal transductionCancerGeneHomeoboxCell biology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A25 Background: The Wnt/β-catenin signaling pathway is a key regulator of cellular growth and differentiation, and its dysregulation has recently been implicated in the molecular pathogenesis of human esophageal adenocarcinoma (EADC). Similarly, the caudal-related homologues (CDX1 and CDX2) are integral to gastrointestinal proliferation and differentiation, and are transcriptional targets of the Wnt/ β-catenin pathway. The aim of this study was to characterize β-catenin, CDX 1 , and CDX 2 mRNA and protein expression in human EADC and to correlate expression profiles with histo-pathologic and clinical parameters including patient survival.Methods: Total RNA was extracted from human esophageal tissues (tumor and matched normal) obtained with informed consent from 28 patients who underwent esophageal resection for primary EADC between 2002 and 2003. Semi-quantitative RT-PCR using primers to amplify target sequences of β-catenin, CDX 1 and CDX 2 was performed and normalized to β-actin as an internal control. Levels of mRNA expression in EADC were determined relative to histologically normal esophageal squamous epithelia from the same patient. Immunohistochemistry (IHC) was used to study protein distribution in corresponding formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections. Statistical analyses were performed to determine associations between expression levels of β-catenin, CDX 1 , CDX 2 , and selected clinico-pathologic parameters (including tumor grade and stage) and postoperative survival (median survival below or greater than 14 months).Results: Overexpression of β-catenin mRNA was found in 10/28 EADCs, and was associated with survival over 14 months (9/10 vs. 9/18, p=0.034). Overexpression of CDX 1 and CDX 2 mRNA was seen in 13/28 and 15/28 EADCs, respectively, but no association with clinico-pathologic parameters or outcome was seen. Although not statistically significant, CDX 1 mRNA overexpression was associated with increased β-catenin mRNA expression (7/10 vs. 6/18, p=0.062). IHC revealed heterogenous patterns of immunoreactivity, with cell nuclear positivity for β-catenin in 12 tumors, and cytoplasmic staining for CDX2 in 21 EADCs.Conclusions: The significant association between β-catenin mRNA expression and survival after esophagectomy suggests that β-catenin may be a useful molecular prognostic marker in patients with EADC. Furthermore, these exploratory studies implicate CDX1 in the molecular pathogenesis of EADC, perhaps through modulation of the Wnt/ β-catenin pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical Cancer ResearchMême sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207