Lack of cable pili expression by cblA-containing Burkholderia cepacia complex a aThe GenBank accession numbers for the complete cblA nucleotide sequences for the isolates listed in Table 1 are AF455151–AF455162.
Notice bibliographique
Résumé
The Burkholderia cepacia complex consists of several closely related bacterial species (or genomovars) which although generally not pathogenic for healthy individuals, contribute significantly to morbidity and mortality among persons with cystic fibrosis (CF). Certain B. cepacia complex strains are more frequently recovered from CF sputum cultures than are others, and these typically reside in genomovar III. The ET12 clone is a genomovar III strain that predominates among CF patients in Canada and the United Kingdom and is characterized by distinctive cblA-encoded pili that have a cable-like morphology. In a previous survey of B. cepacia complex isolates recovered from 606 CF patients in the US, a single genomovar III ET12 isolate (isolate AU0007) was identified; several cblA-containing genomovar I isolates, however, were also detected. In the study reported here, analysis by PFGE revealed several distinct strain types among these genomovar I isolates, and sequence analysis of their cblA genes demonstrated 87.8-88.4% identity to the ET12 cblA sequence. Southern analysis indicated that the cblA variant from each genomovar I isolate resides on a 4 kbp EcoRI fragment, in contrast to ET12 isolates, in which cblA localizes to a 5 kbp EcoRI fragment. Western blot assay indicated expression of the 16 kDa major pilin subunit by ET12 isolates, including AU0007, but neither whole-cell nor surface-protein extracts of the genomovar I reacted. Electron microscopy revealed the complete absence of pili expression by the genomovar I isolates. In contrast to typical ET12 isolates, AU0007 appeared to be hyperpiliated with rigid pili that lacked the cable morphology and did not bind cytokeratin 13, which has been previously identified as the epithelial cell receptor for the ET12 cable-pili-associated adhesin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».