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Enregistrement W1673112447 · doi:10.1111/acv.12045

Low <scp>MHC</scp> variation in the polar bear: implications in the face of <scp>A</scp>rctic warming?

2013· article· en· W1673112447 sur OpenAlexafffund
Diana S. Weber, Peter J. Van Coeverden de Groot, E. Peacock, Mark D. Schrenzel, D. A. Perez, Sufi M. Thomas, Jennifer Shelton, C. K. Else, Laura Darby, Luis E. Acosta, Christopher M. Harris, Jacob P. Youngblood, Peter T. Boag, Rob DeSalle

Notice bibliographique

RevueAnimal Conservation · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensGovernment of NunavutQueen's University
Organismes subventionnairesOffice of Polar ProgramsNunavut Wildlife Management BoardNational Science Foundation
Mots-clésBiologyMajor histocompatibility complexAlleleLinkage disequilibriumHaplotypeEvolutionary biologyGenetic diversityGeneticsDisequilibriumRange (aeronautics)Genetic variationBalancing selectionEcologyImmune systemGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Animals in the A rctic have low pathogen diversity but with rapid climate warming, this is expected to change. One insidious consequence of climate change is exposure of A rctic species to new pathogens derived from more southern species expanding their range northward. To assess potential vulnerability of polar bears to disease exposure, we examined genetic variation in major histocompatibility complex ( MHC ) loci (part of immune system) in C anadian polar bears and found low genetic diversity, consistent with long‐standing exposure to low pathogen/parasite loads. All polar bears surveyed showed maximum linkage disequilibrium between DRB / DQB loci and 12% of individuals had a duplicated DQB gene haplotype. These results may reflect balancing selection at these loci, a response to an earlier immune‐challenge and/or be artifacts of polar bear‐brown bear divergence. Consistent with the latter, we found one DQA allele in polar bears that was also a brown bear DQA allele. The reported low MHC diversity and high linkage disequilibrium may have serious implications for polar bear resistance to new pathogens, which would be maladaptive to species in an environment undergoing rapid climate change, such as the A rctic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,981

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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