Gut microbiome in early pediatric multiple sclerosis: a case-control study (P4.027)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND/OBJECTIVE:Alterations in the gut microbiome may be influential in neurological disease. We explored gut microbiome profiles in early pediatric MS and age and sex matched controls. DESIGN/METHODS:Children ≤18 years old attending a University of California, San Francisco pediatric clinic were invited to participate in a genetic and environmental risk factors study (NS071463,PI:Waubant). MS cases were within 2 years of onset. Controls were free from autoimmune disorders (asthma and eczema allowed). Stools were shipped on ice and stored at -80C. The 16S rRNA gene was amplified from extracted DNA and bacterial profiles were generated using the PhyloChip G3 microarray (Second Genome, Inc., CA). Associations between the pediatric characteristics and variation in the bacterial community composition were assessed using nonmetric multidimensional scaling and permutational multivariate analysis of variance with distance matrices. RESULTS:Between Nov/2011-Nov/2013, 20 MS (10 girls, 10 boys) and 16 controls (9 girls, 7 boys) aged 13.2 years (mean; SD=3.84; range 4-18) provided stool samples. Within two months pre-stool collection, 3 children (2 cases, 1 control) were exposed to an antibiotic, 10 (8 cases, 2 controls) to a corticosteroid and 12 to an immuno-modulatory or -suppressant drug (10 cases, 2 controls). All cases met McDonald criteria, had relapsing-remitting MS and a short disease duration (mean=11 months; range 2-24 at stool collection). The median EDSS at enrolment was 2.0 (range 0-4.0). Preliminary microbiome results indicated significant differences in specific bacterial taxa between cases and controls, with enriched tax predominated by Proteobacteria (e.g. Shigella, Escherichia), p<0.001, false discovery rates, q<0.192. Depleted taxa displayed greater heterogeneity, and included Firmicutes (Eubacterium rectale) and Actinobacteria (Corynebacterium) but also higher false discovery rates (all q<0.372 and p<0.044). CONCLUSIONS:Specific taxa were significantly altered in relative abundance in very early onset pediatric MS, with enrichment for microbiota known to be associated with gastrointestinal infectious processes. Study Supported by:NIH(NS071463);NMSS(RG4861A3/1);PI:Waubant
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».