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Enregistrement W1698049453 · doi:10.1111/j.1742-4658.2012.08676.x

P2Y<sub>2</sub> receptor expression is regulated by C/EBPβ during inflammation in intestinal epithelial cells

2012· article· en· W1698049453 sur OpenAlexafffund
Émilie Degagné, Naomie Turgeon, Julie Moore‐Gagné, Claude Asselin, Fernand‐Pierre Gendron

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCrohn's and Colitis Foundation of CanadaCrohn's and Colitis Foundation
Mots-clésCcaat-enhancer-binding proteinsMolecular biologyTranscription factorChromatin immunoprecipitationBiologyReceptorBinding sitePromoterElectrophoretic mobility shift assayTranscription (linguistics)ColitisP2Y receptorChemistryGene expressionDNA-binding proteinImmunologyGeneBiochemistryPurinergic receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inflammatory bowel diseases are characterized by relapses and remission periods during which numerous factors, including stress factors and nucleotides, are mobilized to re-establish intestinal mucosal homeostasis. We have previously found that expression of the P2Y(2) nucleotide receptor is increased in colonic tissue isolated from inflammatory bowel disease patients as well as in a mouse model of colitis, and that P2Y(2) transcription is regulated in part by nuclear factor κB (NF-κB) p65. Transcription factor DNA-binding site analysis identified three potential CCAAT/enhancer-binding protein β (C/EBPβ) binding sites in the P2Y(2) proximal promoter. We then assessed the role of C/EBP transcription factors in the regulation of P2Y(2) in intestinal epithelial cells (IECs). We identified a region between -229 and -220 bp upstream of the transcription initiation site as a DNA-binding site for C/EBPβ, by electrophoretic mobility and supershift assays. Mutagenesis of this site decreased C/EBPβ-dependent P2Y(2) expression, as assessed by luciferase assays. In vivo, C/EBPβ as well as P2Y(2) expression was increased in colonic IECs isolated from mice with dextran sulfate sodium-induced acute colitis. In contrast, P2Y(2) expression was decreased in C/EBPβ-deficient mice treated with dextran sulfate sodium. Although C/EBPβ was sufficient to induce P2Y(2) transcription, the effect of C/EBPβ and NF-κB p65 on receptor transcription was synergistic. Chromatin immunoprecipitation assays revealed that both proteins simultaneously bind to the P2Y(2) promoter. Thus, we have identified C/EBPβ as a novel regulator of P2Y(2) expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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