Insulation of tumor suppressor genes by the nuclear factor CTCF
Notice bibliographique
Résumé
One of the most outstanding nuclear factors, which has chromatin insulator and transcriptional properties and also contribute to genomic organization, is the zinc-finger protein CCCTC-binding factor (CTCF). Among its multiple functions, a growing amount of evidence implicates CTCF in the epigenetic regulation of genes responsible for the control of the cell cycle, and its mis-regulation can lead to aberrant epigenetic silencing of genes involved in cancer development. Detailed studies are now revealing that CTCF can serve as a barrier against the spread of DNA methylation and histone repressive marks over promoter regions of tumor suppressor genes. Moreover, new evidences points out to the capacity of CTCF to be covalently modified, in particular, through poly(ADP-ribosyl)ation with regulatory consequences. An unexplored aspect of CTCF is its intergenic and intragenic distribution in certain loci. Such distribution seems to facilitate the formation of an optimal chromatin structure and the recruitment of chromatin remodelers with the possible incorporation of RNA polymerase II. Therefore, in the context of tumor suppressor genes and cancer development, CTCF appears to play a relevant role by incorporating a combination of mechanisms involved in the protection against epigenetic silencing components and the maintenance of optimal higher-order organization of the corresponding loci.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».