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Enregistrement W1710157178 · doi:10.1186/s12920-015-0093-1

DNA methylation differences in monozygotic twin pairs discordant for schizophrenia identifies psychosis related genes and networks

2015· article· en· W1710157178 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genomics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHuman geneticsGeneticsSchizophrenia (object-oriented programming)GeneDNA methylationPsychosisBiologyDNA microarrayMethylationMonozygotic twinComputational biologyBioinformaticsPsychologyPsychiatryGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Despite their singular origin, monozygotic twin pairs often display discordance for complex disorders including schizophrenia. It is a common (1%) and often familial disease with a discordance rate of ~50% in monozygotic twins. This high discordance is often explained by the role of yet unknown environmental, random, and epigenetic factors. The involvement of DNA methylation in this disease appears logical, but remains to be established. METHODS: We have used blood DNA from two pairs of monozygotic twins discordant for schizophrenia and their parents in order to assess genome-wide methylation using a NimbleGen Methylation Promoter Microarray. RESULTS: The genome-wide results show that differentially methylated regions (DMRs) exist between members representing discordant monozygotic twins. Some DMRs are shared with parent(s) and others appear to be de novo. We found twenty-seven genes affected by DMR changes that were shared in the affected member of two discordant monozygotic pairs from unrelated families. Interestingly, the genes affected by pair specific DMRs share specific networks. Specifically, this study has identified two networks; "cell death and survival" and a "cellular movement and immune cell trafficking". These two networks and the genes affected have been previously implicated in the aetiology of schizophrenia. CONCLUSIONS: The results are compatible with the suggestion that DNA methylation may contribute to the discordance of monozygotic twins for schizophrenia. Also, this may be accomplished by the direct effect of gene specific methylation changes on specific biological networks rather than individual genes. It supports the extensive genetic, epigenetic and phenotypic heterogeneity implicated in schizophrenia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,471
Score d'incertitude au seuil0,542

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle