Structural analysis of the carbohydrate components of the outer membrane of the lipopolysaccharide‐lacking cellulolytic ruminal bacterium <i>Fibrobacter succinogenes</i> S85
Notice bibliographique
Résumé
The polysaccharides from the outer membrane of the Gram-negative ruminal bacterium Fibrobacter succinogenes were isolated by phenol/water extraction and separated by size-exclusion chromatography in the presence of deoxycholate detergent into a lower-molecular-mass fraction designated 'glycolipid' and a high-molecular-mass 'capsular polysaccharide' fraction. Both fractions lacked typical lipopolysaccharide components including 2-keto-3-deoxyoctulosonic acid and 3-hydroxy fatty acids. Carbohydrate components of these fractions were represented by two polysaccharides and one oligosaccharide (possibly glycolipid) with the following structures: : : where HEAEP is N-(2-hydroxyethyl)-2-aminoethylphosphonic acid, found for the first time in natural compounds. The polysaccharides contained pentadecanoic acid and anteisopentadecanoic acid, possibly present as the acyl components. All constituent monosaccharides except L-rhamnose had a D-configuration. In addition to having a structural role in the outer membrane, these polysaccharides may provide protection for this lipopolysaccharide-less bacterium in the highly competitive ruminal environment, as phosphonic acids covalently linked to membrane polymers have in the past been attributed the function of stabilizing membranes in the presence of phosphatases and lipases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».