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Enregistrement W1713311869 · doi:10.1046/j.1432-1327.2001.02264.x

Structural analysis of the carbohydrate components of the outer membrane of the lipopolysaccharide‐lacking cellulolytic ruminal bacterium <i>Fibrobacter succinogenes</i> S85

2001· article· en· W1713311869 sur OpenAlexaff
Evgeny Vinogradov, Emmanuel E. Egbosimba, Malcolm B. Perry, Joseph S. Lam, Cecil W. Forsberg

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of GuelphInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFibrobacter succinogenesPolysaccharideBacterial outer membraneBiochemistryMonosaccharideLipopolysaccharideBacteriaGlycolipidChemistryRhamnoseBiologyChromatographyRumenFermentationEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The polysaccharides from the outer membrane of the Gram-negative ruminal bacterium Fibrobacter succinogenes were isolated by phenol/water extraction and separated by size-exclusion chromatography in the presence of deoxycholate detergent into a lower-molecular-mass fraction designated 'glycolipid' and a high-molecular-mass 'capsular polysaccharide' fraction. Both fractions lacked typical lipopolysaccharide components including 2-keto-3-deoxyoctulosonic acid and 3-hydroxy fatty acids. Carbohydrate components of these fractions were represented by two polysaccharides and one oligosaccharide (possibly glycolipid) with the following structures: : : where HEAEP is N-(2-hydroxyethyl)-2-aminoethylphosphonic acid, found for the first time in natural compounds. The polysaccharides contained pentadecanoic acid and anteisopentadecanoic acid, possibly present as the acyl components. All constituent monosaccharides except L-rhamnose had a D-configuration. In addition to having a structural role in the outer membrane, these polysaccharides may provide protection for this lipopolysaccharide-less bacterium in the highly competitive ruminal environment, as phosphonic acids covalently linked to membrane polymers have in the past been attributed the function of stabilizing membranes in the presence of phosphatases and lipases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil0,270

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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