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Enregistrement W1719347186

LA BIODIVERSIDAD EN UN CÓDIGO DE BARRAS

2007· article· es· W1719347186 sur OpenAlexaboutno aff
Patricia Escalante, Paul D. N. Hebert

Notice bibliographique

RevueGaceta UNAM (2000-2009) · 2007
Typearticle
Languees
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMexican Socioeconomic and Environmental Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHumanitiesArtGeography
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

POR LA IMPORTANCIA DE SUS COLECCIONES CIENTIFICAS QUE, AL MENOS DESDE HACE 10 ANOS, INVESTIGADORES Y ALUMNOS HAN REUNIDO PARA PRESERVAR CON METODOS QUE PERMITAN LA RECUPERACION DEL ADN CON LA MEJOR CALIDAD POSIBLE, Y NUMERO DE ESPECIALISTAS EN TAXONOMIA DE LA BIODIVERSIDAD EN MEXICO, INSTITUTO DE BIOLOGIA SE UBICA EN UNA INMEJORABLE POSICION PARA PARTICIPAR EN LA PROPUESTA DE INVENTARIAR LA BIODIVERSIDAD DEL PLANETA A TRAVES DE UN CODIGO DE BARRAS, ASEGURO PATRICIA ESCALANTE. ESTA INICIATIVA -CREADA POR PAUL HEBERT, DE LA UNIVERSIDAD DE ONTARIO, CANAD - PODRIA GENERAR RECURSOS PARA COMPLETAR CAT LOGO DE LA BIODIVERSIDAD, LA CONSERVACION DE LAS COLECCIONES Y GRAN SISTEMA INFORM TICO, Y, AL MISMO TIEMPO, DAR RESPUESTA A MUCHAS PREGUNTAS EVOLUTIVAS, SE DIJO TRAS UNA BREVE VISITA REALIZADA RECIENTEMENTE POR INVESTIGADOR ESTADUNIDENSE AL INSTITUTO, DONDE OFRECIO SEMINARIO EL CODIGO DE BARRAS DEL ADN Y LA BIODIVERSIDAD. LA PROPUESTA DE DICHO CODIGO DE BARRAS (BOL, POR SUS SIGLAS EN INGLES) CONSISTE EN UTILIZAR FRAGMENTO INICIAL DEL GEN MITOCONDRIAL COI (CITROMO C OXIDASA SUBUNIDAD I), AMPLIAMENTE DISTRIBUIDO EN FILA DEL REINO ANIMAL Y EN MITOCONDRIAS DE OTROS ORGANISMOS COMO HONGOS, ALGAS Y PLANTAS VASCULARES, PARA DESARROLLAR UN SISTEMA DE IDENTIFICACION DIGITAL A NIVEL DE ESPECIE. LAS PRUEBAS HECHAS HASTA MOMENTO EN DIFERENTES GRUPOS DEMUESTRAN QUE UN FRAGMENTO DE LAS MITOCONDRIAS -DE APROXIMADAMENTE 650 PARES DE BASES-, PUEDE SER UTIL Y SUFICIENTE PARA PROVEER UN CODIGO DE CUATRO LETRAS E INNUMERABLES COMBINACIONES PARA LOGRAR LA IDENTIFICACION DE 99 POR CIENTO DE LAS ESPECIES. AUN CUANDO GRUPOS DE ESPECIES JOVENES NO SE DIAGNOSTICARAN, AL MENOS SE PODRIA LLEGAR A LA DEFINICION DE FAMILIA, GENERO, Y HASTA GRUPO DE ESPECIES EMPARENTADAS A LA CUAL PERTENECE LA MUESTRA. LOS TAXONOMOS HAN HECHO UN TRABAJO MAGNIFICO AL DESCRIBIR LAS ESPECIES, SIN EMBARGO PROBLEMA ES QUE EN 250 ANOS DE DESARROLLO DE ESTA DISCIPLINA SOLAMENTE SE HAN LOGRADO DESCRIBIR UN MILLON Y MEDIO DE ESPECIES, AUNQUE COMO LA ESTIMACION DE SU NUMERO TOTAL EN PLANETA ES DE ENTRE 10 Y CIEN MILLONES, LA TAREA TIENE QUE SER ACELERADA, SOBRE TODO PORQUE MUCHAS DE ELLAS EST N DESAPARECIENDO Y LA GENTE NO PUEDE CONSERVAR LO QUE NO CONOCE, SUBRAYO HEBERT ANTE CIENTIFICOS DE LA DEPENDENCIA UNIVERSITARIA. PARTE DEL PROYECTO BOL CONSISTE EN DESARROLLO DE UN APARATO PORT TIL PARA DETERMINAR LA SECUENCIA COI DE CUALQUIER MUESTRA, Y EN UNOS MINUTOS O SEGUNDOS OBTENER RESULTADO A TRAVES DE ESTA Y LA CONSULTA A UNA BASE DE DATOS POR INTERNET DE TODAS LAS ESPECIES. UNA DE LAS CONSECUENCIAS M S PROMETEDORAS DE ESTE PROYECTO ES ACCESO A LA DETERMINACION TAXONOMICA, QUE SE FACILITARIA ENORMEMENTE PARA QUE MANEJAN RECURSOS NATURALES (COMERCIO DE FLORA Y FAUNA Y CONTROL DE PLAGAS Y RESTAURACION AMBIENTAL POR EJEMPLO), PARA AQUELLOS QUE NO SON EXPERTOS EN GRUPO PERO QUE REQUIEREN DETERMINACIONES, Y PARA ALUMNOS CURIOSOS ACERCA DE LA NATURALEZA, PUES CON SOLO TOCAR LA PIEL POR EJEMPLO DE UNA RANA CON UN PEQUENO PAPEL, Y METERLA AL DNA SEQUENCER HAND HELD DEVISE, SE TENDRIA ACCESO AL NOMBRE CIENTIFICO Y DE ALLI A TODA LA INFORMACION DISPONIBLE EN LA RED. PARA DESARROLLO DE ESTA GIGANTESCA BASE DE DATOS, CANAD  HACE YA IMPORTANTES INVERSIONES DE INVESTIGACION Y, ADEM S, PROPORCIONAR  UNA PARTE SUSTANCIAL DEL FINANCIAMIENTO. SE DAN DETALLES SOBRE TRABAJO REALIZADO POR BOLD. INSTITUTO DE BIOLOGIA SE UNIO A ESTE PROYECTO DESDE HACE DOS ANOS, Y SUS ESPECIALISTAS CONSIDERAN YA USAR LA FORMA DE INTRODUCIR LA LLAMADA SECUENCIACION EN SUS GRUPOS Y PROYECTOS DE INVESTIGACION, EN PARTICULAR EN HELMINTOS, AVES, MAMIFEROS, ORQUIDEAS, CRASUL CEAS Y PINOS. ACTUALMENTE SE TIENE LA PARTICIPACION DECIDIDA DE TRES INVESTIGADORES DE COLEGIO DE LA FRONTERA SUR, EN CHETUMAL, ASI COMO INTERES DE OTROS DEL INSTITUTO DE ECOLOGIA, DEL CENTRO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS DEL NOROESTE Y DEL INSTITUTO POLITECNICO NACIONAL. ESTA INICIATIVA, ASEGURO PATRICIA ESCALANTE, SE CONJUGA BIEN CON PROYECTO INTERDISCIPLINARIO SIBA (SISTEMA DE INFORM TICA PARA LA BIODIVERSIDAD Y AMBIENTE) QUE INSTITUTO DE BIOLOGIA CONDUCE CON APOYO DEL PROGRAMA IMPULSA, YA QUE SE CUENTA EN LINEA CON APROXIMADAMENTE 200 MIL REGISTROS DE LAS COLECCIONES BOT NICAS Y ZOOLOGICAS Y EST  A PUNTO DE LANZARSE UN PORTAL DE IM GENES, LO QUE FACILITAR  CONECTARSE AL SISTEMA DEL CODIGO DE BARRAS DE LA VIDA. LA ESPECIALISTA, QUIEN PARTICIPA EN LA INICIATIVA PARA CONSTRUIR LA PARTE DE LAS AVES, LE MOSTRO A SU HOMOLOGO PAUL HEBERT LAS COLECCIONES M S IMPORTANTES DEL INSTITUTO PARA ESTA INICIATIVA, SUS LABORATORIOS Y UNIDAD INFORM TICA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,222
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
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