Quantification of type VI secretion system activity in macrophages infected with Burkholderia cenocepacia
Notice bibliographique
Résumé
The Gram-negative bacterial type VI secretion system (T6SS) delivers toxins to kill or inhibit the growth of susceptible bacteria, while other secretion systems target eukaryotic cells. Deletion of atsR, a negative regulator of virulence factors in B. cenocepacia K56-2, increases T6SS activity. Macrophages infected with a K56-2 ΔatsR mutant display dramatic alterations in their actin cytoskeleton architecture that rely on the T6SS, which is responsible for the inactivation of multiple Rho-family GTPases by an unknown mechanism. We employed a strategy to standardize the bacterial infection of macrophages and densitometrically quantify the T6SS-associated cellular phenotype, which allowed us to characterize the phenotype of systematic deletions of each gene within the T6SS cluster and ten vgrG genes in K56-2 ΔatsR. None of the genes from the T6SS core cluster nor the individual vgrG genes were directly responsible for the cytoskeletal changes in infected cells. However, a mutant strain with all vgrG genes deleted was unable to cause macrophage alterations. Despite not being able to identify a specific effector protein responsible for the cytoskeletal defects in macrophages, our strategy resulted in the identification of the critical core components and accessory proteins of the T6SS assembly machinery and provides a screening method to detect T6SS effectors targeting the actin cytoskeleton in macrophages by random mutagenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».