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Enregistrement W1728403685 · doi:10.1186/1742-4690-3-s1-s4

HIV-1 subtype C viruses rapidly develop K65R

2006· article· en· W1728403685 sur OpenAlexaff
Mark A. Wainberg, Florence Doualla‐Bell, Tedani Gaolatte, Madisa Mine, Max Essex, Bluma Brenner

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyHuman immunodeficiency virus (HIV)MedicineAntibodyComputational biologyBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The K65R substitution can cause extensive cross-resistance among currently used NRTIs, yet this mutation has rarely been observed among subtype B infected individuals who receive antiretroviral (ARV) drugs. We evaluated the incidence of K65R in subtype C patients in Botswana, who received ARV therapy in the context of first and second line regimens by studying the reverse transcriptase (RT) genotypes of 23 individuals who failed therapy, while on combination regimens that included ddI and d4T. Ten of these individuals had initiated treatment with ddI/d4T-based regimens while 13 had started therapy with ZDV/3TC/NVP or ZDV/3TC/EFV prior to switching to ddI-and/or d4T-containing combinations. Of the 23 patients, 7 possessed K65R and no-one possessed L74V after a median exposure to combination ddI/d4T of only eight months (range 4–18 months). In contrast, none of 13 patients who received 3TC/ZDV as initial therapy prior to d4T/ddI developed K65R, although most of them developed thymidine-associated mutations (TAMs); this is potentially due to antagonism between TAMs and K65R. In tissue culture studies, K65R was detected after only 12 weeks in 4/4 and 3/4 selections with Tenofovir and ddI, respectively, but far longer periods were required for relatively infrequent selection of K65R by Tenofovir with subtype B viruses (>40 weeks; 2/7 selections). K65R may emerge at higher frequency in individuals infected with subtype C viruses who experience treatment with certain NRTIs, establishing the need to monitor for the presence of this mutation and its possible transmission.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,539
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,027

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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