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Enregistrement W1789945456 · doi:10.3233/jad-2010-1254

Quantitative Changes in the Mitochondrial Proteome from Subjects with Mild Cognitive Impairment, Early Stage, and Late Stage Alzheimer's Disease

2010· article· en· W1789945456 sur OpenAlexfundno aff
Bert C. Lynn, Jianquan Wang, William R. Markesbery, Mark A. Lovell

Notice bibliographique

RevueJournal of Alzheimer s Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institute for Theoretical AstrophysicsNational Institute on AgingUniversity of Kentucky
Mots-clésPathogenesisMitochondrionAlzheimer's diseaseDiseaseVoltage-dependent anion channelProteomeBiologyTandem mass tagDementiaInternal medicineBioinformaticsMedicineProteomicsPathologyBiochemistryQuantitative proteomicsBacterial outer membrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The major barrier to treating or preventing Alzheimer's disease (AD) is its unknown etiology and pathogenesis. Although increasing evidence supports a role for mitochondrial dysfunction in the pathogenesis of AD, there have been few studies that simultaneously evaluate changes in multiple mitochondrial proteins. To evaluate changes in sites of potentially interacting mitochondrial proteins, we applied 2-dimensional liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry and the isotope coded affinity tag method to identify and quantify proteins in mitochondrial enriched fractions isolated from short postmortem interval temporal pole specimens from subjects with mild cognitive impairment (4 subjects pooled), early AD (4 subjects pooled), late-stage AD (8 subjects pooled) and age-matched normal control (7 subjects pooled) subjects. A total of 112 unique, non-redundant proteins were identified and quantified in common to all three stages of disease progression. Overall, patterns of protein change suggest activation of mitochondrial pathways that include proteins responsible for transport and utilization of ATP. These proteins include adenine nucleotide translocase, voltage dependent anion channels, hexokinase, and creatine kinase. Comparison of protein changes throughout the progression of AD suggests the most pronounced changes occur in early AD mitochondria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,659
Score d'incertitude au seuil0,685

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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