Differential transcriptome analyses of three wheat genotypes reveal different host response pathways associated with Fusarium head blight and trichothecene resistance
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium head blight is a disease of cereal crops caused by a group of trichothecene‐producing Fusarium species. In the current study, three wheat genotypes with cv. Superb pedigree were evaluated for their ability to activate different defence‐response pathways when exposed to one of three elicitors: (i) trichothecene‐producing and (ii) non‐producing F. graminearum strains, and (iii) the trichothecene toxin deoxynivalenol. Spikelets distal to the inoculation point were harvested at multiple time points in order to identify systemic temporal changes in transcript accumulation associated with resistance. Distinct differences were observed between the resistant genotypes and cv. Superb, as well as between the two resistant genotypes. The current data suggest that different molecular mechanisms exist not only between susceptibility and resistance responses, but between different forms of genetic resistance. It is proposed that Type 1 resistance in one of the resistant double haploid lines evaluated here involves a combination of structural features that slow fungal penetration and activation of a systemic response in uninfected tissues adjacent to the site of infection to prevent or minimize secondary infection; in contrast, Type 2 resistance is more likely a form of local resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».