MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W181614955 · doi:10.1096/fasebj.21.5.a542-b

Hepatocyte nuclear factor 4alpha (HNF‐4α) promotes polarization and activates vectorial transport in intestinal epithelial cell

2007· article· en· W181614955 sur OpenAlexafffund
Carine Lussier, Jean‐Philippe Babeu, François Boudreau

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePediatric Hepatobiliary Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCDX2BiologyMolecular biologyCell biologyHepatocyte nuclear factorsCell cultureGene expressionWestern blotTranscription factorCellGeneGeneticsHomeobox

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this work was to identify transcription factors implicated in the regulation of intestinal epithelial cell (IEC) differentiation. METHODS AND RESULTS: An IEC‐6 cell line that expressed Cdx2 (IEC6‐L1) was induced to polarize and differentiate when co‐cultured 8 days with intestinal mesenchymal cells (IMC). Co‐cultured cells were harvested at days 1, 3, 5 and 8 and submitted to a gene expression analysis. HNF‐4α was not expressed at days 1 and 3 and began to be detectable at the mRNA level at day 5 when clusters of polarizing cells appeared. Western blot analysis confirmed that HNF‐4α was detectable around co‐culture day 6 and immunolocalization analysis showed that it was strictly expressed by clusters of polarized cells. The gene profiling analysis revealed numerous putative targets of HNF‐4α among the up‐regulated genes. Retroviral construct allowing the expression of HNF‐4α cDNA was used to stably infect IEC6‐L1 cells. When co‐cultured with IMC, IEC6‐L1/HNF‐4α polarized more rapidly than controls and formed dome‐like elevations. Electron microscopy confirmed that IEC6‐L1/HNF‐4α accumulated material between their bases and the subjacent IMC monolayer. CONCLUSION: HNF‐4α was recently implicated in the regulation of specific intestinal‐differentiated genes. Our results strongly suggest that HNF‐4α is implicated in IEC polarization, functional absorption and transport. (Work supported by CIHR, NSERC, FRSQ)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB JournalMême sujetPediatric Hepatobiliary Diseases and TreatmentsTravaux en français237 207