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The human transcriptome across tissues and individuals

2015· article· en· 1 427 citations· W1816176398 sur OpenAlex· 10.1126/science.aaa0355

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants
0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Transcriptional regulation and posttranscriptional processing underlie many cellular and organismal phenotypes. We used RNA sequence data generated by Genotype-Tissue Expression (GTEx) project to investigate the patterns of transcriptome variation across individuals and tissues. Tissues exhibit characteristic transcriptional signatures that show stability in postmortem samples. These signatures are dominated by a relatively small number of genes—which is most clearly seen in blood—though few are exclusive to a particular tissue and vary more across tissues than individuals. Genes exhibiting high interindividual expression variation include disease candidates associated with sex, ethnicity, and age. Primary transcription is the major driver of cellular specificity, with splicing playing mostly a complementary role; except for the brain, which exhibits a more divergent splicing program. Variation in splicing, despite its stochasticity, may play in contrast a comparatively greater role in defining individual phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Science
Thématique
Genomics and Chromatin Dynamics
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
McGill University
Organismes subventionnaires
National Human Genome Research InstituteH2020 European Research CouncilNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Heart, Lung, and Blood InstituteLouis-Jeantet Foundation
Mots-clés
BiologyGenetic variationTranscriptomeGeneGene expressionExpression quantitative trait lociGeneticsGenotypeRegulation of gene expressionEvolutionary biologySingle-nucleotide polymorphism
Résumé présent dans OpenAlex
oui