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Enregistrement W1825210022 · doi:10.1002/ana.24215

Genetic association signal near <scp><i>NTN</i></scp><i>4</i> in <scp>T</scp>ourette syndrome

2014· review· en· W1825210022 sur OpenAlexaff
Peristera Paschou, Dongmei Yu, Gloria F. Gerber, Patrick Evans, Fotis Tsetsos, Lea K. Davis, Iordanis Karagiannidis, Jonathan Chaponis, Eric R. Gamazon, Kirsten Mueller‐Vahl, Manfred Stuhrmann, Monika Schloegelhofer, M. Stamenković, Johannes Hebebrand, Markus M. Nöethen, Péter Nagy, Csaba Barta, Zsanett Tárnok, Renata Rizzo, Christel Depienne, Yulia Worbe, Andreas Hartmann, Daniëlle C. Cath, Cathy L. Budman, Paul Sandor, Cathy L. Barr, Tomasz Wolańczyk, Harvey Singer, I‐Ching Chou, Marco A. Grados, Daniëlle Posthuma, Guy A. Rouleau, H.N. Aschauer, Nelson B. Freimer, David L. Pauls, Nancy J. Cox, Carol A. Mathews, Jeremiah M. Scharf

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2014
Typereview
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalOntario HIV Treatment NetworkMcGill UniversityUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental Health
Mots-clésGenome-wide association studyBonferroni correctionSingle-nucleotide polymorphismGenetic associationAlleleTourette syndromeGeneticsPutamenEtiologyBiologyMedicineInternal medicineNeuroscienceGenotypeGenePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tourette syndrome (TS) is a neurodevelopmental disorder with a complex genetic etiology. Through an international collaboration, we genotyped 42 single nucleotide polymorphisms (p < 10(-3) ) from the recent TS genomewide association study (GWAS) in 609 independent cases and 610 ancestry-matched controls. Only rs2060546 on chromosome 12q22 (p = 3.3 × 10(-4) ) remained significant after Bonferroni correction. Meta-analysis with the original GWAS yielded the strongest association to date (p = 5.8 × 10(-7) ). Although its functional significance is unclear, rs2060546 lies closest to NTN4, an axon guidance molecule expressed in developing striatum. Risk score analysis significantly predicted case-control status (p = 0.042), suggesting that many of these variants are true TS risk alleles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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