Morphological and molecular diversity of the wild carrot <i>Daucus pusillus</i>: implications for classification and ex situ conservation
Notice bibliographique
Résumé
Daucus pusillus Michx. and Daucus montevidensis Link ex Spreng. are wild carrots from the Americas with unresolved taxonomic status. An investigation was carried out with accessions of D. pusillus and (or) D. montevidensis from Argentina for (i) morphological and molecular (amplified fragments length polymorphism (AFLP) and inter simple sequence repeat (ISSR)) characterization, (ii) analysis of congruence of morphological and molecular variation, and (iii) comparison of diversity for the internal transcribed spacer (ITS) region with that reported for a North American accession of D. pusillus. Twelve accessions of D. pusillus and (or) D. montevidensis — representing their geographical distribution in Argentina — and one accession each of wild Daucus carota L. and Daucus montanus Humb. & Bonpl. ex Schult. — as outgroups — were included. In the multivariate analysis of morphological diversity, two accessions were clearly differentiated; this result is not sustained by multivariate analysis of molecular diversity. Based on multivariate and molecular variance (AMOVA) analyses, D. pusillus and (or) D. montevidensis accessions were separated at the molecular level into two groups, associated with geographical origin. Because this result is not supported by morphology, the segregation into two taxa seems unjustified. In all accessions, ITS and 5.8S rDNA regions had identical sequences, which differ in one nucleotide from the corresponding sequence of the North American accession. According to the combined results, D. pusillus would be a single taxon distributed from North to South America, and D. montevidensis a nomenclatural synonym. Autogamy of D. pusillus and its highly structured genetic diversity (Fst = 0.86) allows the application of a geographically targeted approach for germplasm exploration, conservation and eventual use in pre-breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».