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Enregistrement W1829064814 · doi:10.1139/cjb-2013-0241

Morphological and molecular diversity of the wild carrot <i>Daucus pusillus</i>: implications for classification and ex situ conservation

2014· article· en· W1829064814 sur OpenAlexvenueno aff
Maria S. Ibañez, Elsa Lucila Camadro, Carlos A. Sala, Ricardo W. Masuelli

Notice bibliographique

RevueBotany · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversidad Nacional de Mar del PlataConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Mots-clésBiologyDaucus carotaBotanyTaxonEx situ conservationAmplified fragment length polymorphismGenetic diversityZoologyPopulationEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Daucus pusillus Michx. and Daucus montevidensis Link ex Spreng. are wild carrots from the Americas with unresolved taxonomic status. An investigation was carried out with accessions of D. pusillus and (or) D. montevidensis from Argentina for (i) morphological and molecular (amplified fragments length polymorphism (AFLP) and inter simple sequence repeat (ISSR)) characterization, (ii) analysis of congruence of morphological and molecular variation, and (iii) comparison of diversity for the internal transcribed spacer (ITS) region with that reported for a North American accession of D. pusillus. Twelve accessions of D. pusillus and (or) D. montevidensis — representing their geographical distribution in Argentina — and one accession each of wild Daucus carota L. and Daucus montanus Humb. & Bonpl. ex Schult. — as outgroups — were included. In the multivariate analysis of morphological diversity, two accessions were clearly differentiated; this result is not sustained by multivariate analysis of molecular diversity. Based on multivariate and molecular variance (AMOVA) analyses, D. pusillus and (or) D. montevidensis accessions were separated at the molecular level into two groups, associated with geographical origin. Because this result is not supported by morphology, the segregation into two taxa seems unjustified. In all accessions, ITS and 5.8S rDNA regions had identical sequences, which differ in one nucleotide from the corresponding sequence of the North American accession. According to the combined results, D. pusillus would be a single taxon distributed from North to South America, and D. montevidensis a nomenclatural synonym. Autogamy of D. pusillus and its highly structured genetic diversity (Fst = 0.86) allows the application of a geographically targeted approach for germplasm exploration, conservation and eventual use in pre-breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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