MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1840818938 · doi:10.1080/15384101.2014.998056

Structural convergence of unstructured p53 family transactivation domains in MDM2 recognition

2015· article· en· W1840818938 sur OpenAlex
Jae‐Sun Shin, Ji‐Hyang Ha, Dong-Hwa Lee, Kyoung‐Seok Ryu, Kwang‐Hee Bae, Byoung Chul Park, Sung Goo Park, Gwan‐Su Yi, Seung‐Wook Chi

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensKootenay Association for Science & Technology
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransactivationIsothermal titration calorimetryCircular dichroismBiologyMdm2BiophysicsMutagenesisPhosphorylationBinding siteComputational biologyPlasma protein bindingBiochemistryTranscription factorCell biologyMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The p53, p63, and p73 proteins belong to the p53 family of transcription factors, which play key roles in tumor suppression. Although the transactivation domains (TADs) of the p53 family are intrinsically disordered, these domains are commonly involved in the regulatory interactions with mouse double minute 2 (MDM2). In this study, we determined the solution structure of the p73TAD peptide in complex with MDM2 using NMR spectroscopy and biophysically characterized the interactions between the p53 family TAD peptides and MDM2. In combination with mutagenesis data, the complex structures revealed remarkably close mimicry of the MDM2 recognition mechanism among the p53 family TADs. Upon binding with MDM2, the intrinsically disordered p73TAD and p63TAD peptides adopt an amphipathic α-helical conformation, which is similar to the conformation of p53TAD, although the α-helical content induced by MDM2 binding varies. With isothermal titration calorimetry (ITC) and circular dichroism (CD) data, our biophysical characterization showed that p73TAD resembles p53TAD more closely than p63TAD in terms of helical stability, MDM2 binding affinity, and phosphorylation effects on MDM2 binding. Therefore, our structural information may be useful in establishing alternative anticancer strategies that exploit the activation of the p73 pathway against human tumors bearing p53 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle