Rumen microbial community composition varies with diet and host, but a core microbiome is found across a wide geographical range

2015· article· en· 1 734 citations· W1842963151 sur OpenAlex· 10.1038/srep14567

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,041

Tête enseignante GPT0,256

Écart entre enseignants: 0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Ruminant livestock are important sources of human food and global greenhouse gas emissions. Feed degradation and methane formation by ruminants rely on metabolic interactions between rumen microbes and affect ruminant productivity. Rumen and camelid foregut microbial community composition was determined in 742 samples from 32 animal species and 35 countries, to estimate if this was influenced by diet, host species, or geography. Similar bacteria and archaea dominated in nearly all samples, while protozoal communities were more variable. The dominant bacteria are poorly characterised, but the methanogenic archaea are better known and highly conserved across the world. This universality and limited diversity could make it possible to mitigate methane emissions by developing strategies that target the few dominant methanogens. Differences in microbial community compositions were predominantly attributable to diet, with the host being less influential. There were few strong co-occurrence patterns between microbes, suggesting that major metabolic interactions are non-selective rather than specific.

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La notice

Revue: Scientific Reports
Thématique: Ruminant Nutrition and Digestive Physiology
Domaine: Agricultural and Biological Sciences
Établissements canadiens: University of AlbertaAgriculture and Agri-Food CanadaThompson Rivers University
Organismes subventionnaires: Secretaría de Agricultura, Ganadería, Desarrollo Rural, Pesca y AlimentaciónProduct Board Animal FeedFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisJavna Agencija za Raziskovalno Dejavnost RSAgencia Nacional de Investigación e InnovaciónNew Zealand GovernmentScience Foundation IrelandFerdowsi University of MashhadRural Development AdministrationAlberta Livestock and Meat AgencyInstituto Nacional de Tecnología AgropecuariaAustralian GovernmentRural and Environment Science and Analytical Services DivisionScottish GovernmentConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoMontana Agricultural Experiment StationAgResearch
Mots-clés: MicrobiomeRumenHost (biology)Composition (language)MetagenomicsRange (aeronautics)Microbial population biologyBiologyBioinformaticsEcologyFood scienceBacteriaGeneticsFermentationGene
Résumé présent dans OpenAlex: oui
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