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Enregistrement W1844542617 · doi:10.1139/cjb-2012-0212

Phylogeography based on intraspecific sequence variation in chloroplast DNA of<i>Miscanthus sinensis</i>(Poaceae), a native pioneer grass in Japan

2013· article· en· W1844542617 sur OpenAlexvenueno aff
Yoshiko Shimono, Shunji Kurokawa, Tomoko Nishida, Hiroaki Ikeda, Norihiko Futagami

Notice bibliographique

RevueBotany · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBioenergy crop production and management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMiscanthus sinensisPhylogeographyGenetic structureChloroplast DNAGene flowIntraspecific competitionEcologyMiscanthusGenetic variationIntrogressionPhylogenetic treeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Miscanthus sinensis Andersson is a dominant perennial grass in East Asia, where it is a pioneer species in disturbed habitats. To obtain basic information about the genetic structure of this pioneer species, we investigated chloroplast DNA (cpDNA) variation in M. sinensis within and among native populations across Japan. We detected nine haplotypes in 636 individuals from 30 populations. Two distinct haplotypes had a wide geographical distribution and coexisted within most of the populations. The degree of genetic differentiation among the populations was relatively low. Two putative ancestral lineages were distributed in the Ryukyu Islands. Therefore, it is possible that lineages that originated in subtropical areas of mainland China migrated into the Ryukyu Islands via Taiwan. Another possible migration route is the Korean Peninsula. Two major haplotypes may have migrated from the Eurasian continent to the northern coast in Kyushu via the Korean Peninsula and then expanded throughout Japan. There was no clear genetic boundary among the populations north of Kyushu. The enhanced immigration ability and high rate of gene flow of Miscanthus may have modulated the genetic structure created during previous glacial periods. Alternatively, the shortage of unique haplotypes north of Kyushu may indicate the recent expansion of this species to northern Japan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,969
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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