Phylogeography based on intraspecific sequence variation in chloroplast DNA of<i>Miscanthus sinensis</i>(Poaceae), a native pioneer grass in Japan
Notice bibliographique
Résumé
Miscanthus sinensis Andersson is a dominant perennial grass in East Asia, where it is a pioneer species in disturbed habitats. To obtain basic information about the genetic structure of this pioneer species, we investigated chloroplast DNA (cpDNA) variation in M. sinensis within and among native populations across Japan. We detected nine haplotypes in 636 individuals from 30 populations. Two distinct haplotypes had a wide geographical distribution and coexisted within most of the populations. The degree of genetic differentiation among the populations was relatively low. Two putative ancestral lineages were distributed in the Ryukyu Islands. Therefore, it is possible that lineages that originated in subtropical areas of mainland China migrated into the Ryukyu Islands via Taiwan. Another possible migration route is the Korean Peninsula. Two major haplotypes may have migrated from the Eurasian continent to the northern coast in Kyushu via the Korean Peninsula and then expanded throughout Japan. There was no clear genetic boundary among the populations north of Kyushu. The enhanced immigration ability and high rate of gene flow of Miscanthus may have modulated the genetic structure created during previous glacial periods. Alternatively, the shortage of unique haplotypes north of Kyushu may indicate the recent expansion of this species to northern Japan.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».